文献类型： 中文期刊

作者： 杨建敏 ¹ ; 胡宇平 ¹ ; 林威敏 ¹ ; 张金耀 ¹ ; 黄守婷 ¹ ; 叶鼎承 ² ; 肖天放 ¹ ;

作者机构： 1.福建农林大学动物科学学院

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 槐猪;杜洛克猪;背最长肌;差异表达;转录组测序

期刊名称： 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-5470

年卷期： 2016 年 45 卷 02 期

页码： 192-195

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.