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番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 芦佳 1 ; 刘健 1 ; 王慧 2 ; 肖雅文 1 ; 李常保 3 ;

作者机构： 1.内蒙古师范大学生命科学与技术学院北京市农林科学院农业生物技术研究中心北京市农林科学院蔬菜研究中心

2.北京市农林科学院农业生物技术研究中心内蒙古师范大学生命科学与技术学院内蒙古农业大学生态环境学院

3.青岛农业大学农学与植保学院

关键词： 番茄黄化曲叶病毒;分子检测;序列分析;进化

期刊名称： 内蒙古大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-1638

年卷期： 2014 年 03 期

页码： 273-280

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNA-A序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA-B和卫星DNA-β,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV-BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.1~99.9%,属于以色列TYLCV-IL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV-Mld进化成TYLCV-IL时,AC1和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CN I亚群.

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