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基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建

文献类型: 中文期刊

作者: 孙湘来 1 ; 陈新 2 ; 文明富 2 ; 卢诚 2 ; 周玉飞 2 ; 王文泉 2 ;

作者机构: 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院生物技术研究所

关键词: 木薯;EST-SSR;分子标记;遗传连锁图谱

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2011 年 27 卷 09 期

页码: 231-236

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 此实验以木薯推广品种KU50为母本,SC124为父本通过杂交得到包含240个单株的F1分离群体,利用300对EST-SSR引物,20对SSR和20对SRAP引物组合对亲本和部分群体株系进行多态性分子标记筛选,共获得具有多态性的引物110对。在此基础上,利用这110对多态性引物对该F1群体进行分子标记的多态性分析,共获得269个多态性标记。利用JoinMap3.0软件对这269个多态性标记进行分组和遗传图谱构建,最后获得了一张包含140个标记的木薯分子遗传连锁图谱,其中EST-SSR标记111个,SSR标记22个,SRAP标记7个;共21个连锁群,其中连锁群1和3(LG1、LG3)上的标记位点最多(15个),LG21标记位点最少(2个)。此遗传连锁图谱的总长度为1314.775cM,单个连锁群最长为132.904cM(LG3),最短为0.431cM(LG19),标记间平均长度9.391cM。

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