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利用巴西橡胶树寡核苷酸芯片筛选死皮相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 李德军 1 ; 覃碧 2 ; 邓治 2 ; 刘向红 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

2.中国热带农业科学院橡胶研究所,农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室;海南大学农学院

关键词： 巴西橡胶树;树皮;死皮分子机制;死皮相关基因;寡核苷酸芯片

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2012 年 48 卷 09 期

页码： 901-908

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以健康和死皮巴西橡胶树品系热研7-33-97树皮为实验材料,利用定制橡胶树寡核苷酸芯片筛选橡胶树死皮相关基因。在橡胶树寡核苷酸芯片包含的566个基因中,死皮与健康树树皮差异表达倍数在2倍或2倍以上的有56个,占筛选转录本总数的9.9%。在56个死皮相关基因中,死皮树中上调表达基因有3个,下调表达基因有53个。这些死皮相关基因共涉及8个功能分类,"抗性及防御反应"所占比例最高,接下来是"蛋白质合成、加工及转运"和"代谢和能量",以上三类功能基因占66.07%。此外,死皮相关基因还涉及"细胞结构、生长及分化"、"细胞信号转导"、"转录相关"、"橡胶生物合成"和"未知功能"。为验证芯片结果的可信性,随机选取18个基因进行RT-PCR分析,结果表明被检测基因表达模式均与芯片结果完全一致。本研究鉴定并分析了死皮相关基因,为进一步揭示橡胶树死皮发生机制奠定了基础。

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