您好,欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库!

植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王鹏 1 ; 罗朝鹏 2 ; 盖江涛 3 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院

2.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院

3.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院;

关键词: 鸟氨酸脱羧酶;精氨酸脱羧酶;基因家族;进化

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 01 期

页码: 96-101

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义。为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达。首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因。对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因。人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早。拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失。ADC基因在植物登陆后才得以进化形成。DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制。

  • 相关文献

[1]植物UDP-葡萄糖焦磷酸化酶家族基因鉴定及序列进化分析. 白蓓蓓,陈业渊,盖江涛,叶秀旭,王鹏. 2019

[2]植物蔗糖合酶家族基因鉴定及序列和进化分析. 白蓓蓓,陈业渊,王鹏. 2018

[3]橡胶树ADC1的克隆、表达及生物信息学分析. 侯岚菲,杨洪,邓治,代龙军,门中华,李德军. 2018

[4]橡胶树ADC1的克隆、表达及生物信息学分析. 侯岚菲,杨洪,邓治,代龙军,门中华,李德军. 2018

[5]植物肉桂醇脱氢酶及其基因研究进展. 张鲁斌,谷会,弓德强,常金梅. 2011

[6]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[7]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[8]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[9]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[10]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[11]香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析. 董晨,贾利强,决登伟,赵秋芳,陈宏良,胡会刚. 2016

[12]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[13]香蕉SPS基因家族的系统进化分析. 陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清. 2021

[14]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 2016

[15]基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析. 鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊. 2019

[16]茄科植物木糖转移酶家族基因挖掘与进化分析. 王鹏,李慧,简熠,吕勇志,盖江涛. 2018

[17]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020

[18]11个玉米bZIP基因应答逆境胁迫的表达分析. 贾利强,赵秋芳,陈曙. 2022

[19]巴西橡胶树膜联蛋白基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,王闯,唐朝荣. 2016

[20]巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,阳江华,秦云霞,唐朝荣. 2016

作者其他论文 更多>>