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植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王鹏 1 ; 罗朝鹏 2 ; 盖江涛 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院

2.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院

3.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;中国烟草总公司郑州烟草研究院;

关键词： 鸟氨酸脱羧酶;精氨酸脱羧酶;基因家族;进化

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 96-101

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义。为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达。首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因。对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因。人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早。拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失。ADC基因在植物登陆后才得以进化形成。DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制。

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