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油梨基因组DNA提取、SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 周海兰 1 ; 李绍鹏 1 ; 李卫亮 1 ; 贺军虎 2 ; 包冬红 1 ; 李茂富 1 ;

作者机构: 1.海南大学园艺园林学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 油梨;DNA提取;SSR标记;体系优化;引物筛选

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2016 年 32 卷 04 期

页码: 143-150

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在建立稳定可靠的油梨(Persea americana Mill)叶片DNA的提取方法和SSR-PCR反应体系及筛选出稳定的油梨SSR多态性引物,为开展油梨种质SSR分子标记提供遗传研究的基础。以油梨叶片为试材,比较3种油梨叶片DNA提取方法 ;利用L16(45)正交实验设计对油梨SSR-PCR反应体系进行优化;利用优化的反应体系筛选引物;同时,选取5对多态性引物对45份油梨种质进行PCR扩增,进一步检测该优化体系的稳定性。结果表明,常规2×CTAB法、改良2×CTAB法和植物DNA提取试剂盒法等3种DNA提取方法中,改良2×CTAB法对油梨基因组DNA的提取效果最佳;获得最优反应体系为:20μL总反应体系中,含约40 ng DNA模板、1.5 mmol/L Mg~(2+)、0.15 mmol/L d NTPs、0.5 U Taq DNA聚合酶、0.5μmol/L引物;以此体系为基础进行引物筛选,从73对油梨SSR引物中筛选出了30对扩增条带清晰的多态性引物,说明该反应体系可用于油梨SSR标记的进一步研究;稳定性检测获得的谱带清晰,表明该优化反应体系是稳定可靠的。由此可见,改良的2×CTAB法可用于油梨叶片DNA的大量样本提取,优化后的SSR-PCR反应体系及筛选出的30对多态性引物可用于油梨SSR标记的进一步研究。

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