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海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭安平 1 ; 彭于发 2 ; 刘恩平 1 ; 孔华 1 ; 林海妹 1 ; 贺立卡 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.中国农业科学院植物保护研究所

关键词： 普通野生稻;核糖体DNA;ITS区;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2008 年 29 卷 04 期

页码： 478-484

收录情况： CSTPCD

摘要： 以转bar基因粳稻(O. sativa ssp. japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O. rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析。结果表明,ITS全长为586～589 bp,其中ITS1为193～195 bp,共有20个变异位点数,G/C含量为72.02%～74.74%;ITS2为229～231 bp,共有12个变异位点数,G/C含量为75.55%～76.08%;离栽培稻越近的类群G/C含量越高。所有材料5.8S rDNA序列完全一致,全长164 bp,G/C占97 bp,含量为59.15%。各类群间ITS序列信息较丰富,且显示ITS1比ITS2进化速度要快。利用ITS差异信息序列进行聚类分析为鉴别不同居群的普通野生稻提供了分子依据。

  • 相关文献

[1]海南普通野生稻不同居群rDNAITS区序列的比较分析. 郭安平,彭于发,刘恩平,孔华,林海妹,贺立卡. 2008

[2]海南普通野生稻Waxy基因的分离和序列分析. 徐靖,朱家红,韩义胜,严小微,王效宁. 2012

[3]芭蕉属rDNA的ITS序列分析. 王静毅,陈雪婷,马子龙,武耀廷. 2013

[4]海南普通野生稻居群植被物种多样性研究. 徐中亮,李厚奇,何美丹,袁潜华. 2012

[5]海南主要普通野生稻的调查及利用RAPD技术进行鉴别分析. 王晓玲,郭安平,孔华,刘恩平,贺立卡. 2008

[6]海南普通野生稻籼粳分化的SSR分析. 崔莹莹,郭安平,王晓玲,郭运玲,孔华,贺立卡. 2009

[7]RAPD和SSR标记检测海南普通野生稻籼粳分化的比较研究. 崔莹莹,郭安平,王晓玲,孔华,郭运玲,贺立卡. 2009

[8]海南普通野生稻的花粉育性观察及杂交亲和性. 贺晃,王晓玲,符儒民,郭安平,刘恩平,孔华,贺立卡. 2007

[9]海南儋州普通野生稻开花习性及育性研究. 王晓玲,余洁,郭安平,庞业平,彭于发,刘恩平,孔华,贺立卡. 2008

[10]海南万宁普通野生稻居群开花习性和生殖特性研究. 孔华,彭于发,郭安平. 2008

[11]普通野生稻抗旱性初探. 林海妹,郭安平,王晓玲,郭运玲,孔华,贺立卡. 2009

[12]普通野生稻与栽培稻杂交后代游离小孢子的培养. 王玲仙,付坚,尹明,张敦宇,郭怡卿,罗利军,程在全. 2012

[13]橡胶棒孢霉落叶病菌rDNA-ITS区的PCR扩增与序列分析. 漆艳香,张欣,蒲金基,李顺利,张贺,张辉强,黄思良,谢艺贤. 2009

[14]枯草芽孢杆菌CAS15嗜铁素基因dhbC的克隆、表达及功能鉴定. 余贤美,林超,郑服丛,贺春萍,张修国. 2009

[15]黑曲霉G-1125生淀粉糖化酶基因的克隆与序列分析. 孙海彦,黎娟华,刘恩世,易小平,杨景豪,尹一伊,彭明. 2015

[16]香蕉rbcS基因启动子的克隆及序列分析. 刘德兵,魏军亚,李飞,贺军虎,魏守兴,谢子四,陈业渊. 2010

[17]结核分支杆菌耐异烟肼基因inhA突变的测序研究. 朱中元,邵寒霜,陈允凤,王海波. 2000

[18]海南黑山羊鞭虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析. 荣光,周汉林,侯冠彧,王东劲,赵军明. 2010

[19]新牧一号杂花苜蓿MvNHX1基因的表达分析和提高烟草耐盐性的研究. 张桦,张富春,张雨良,张博,陈全家. 2011

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