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木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李建君 1 ; 郭鑫 2 ; 林晨俞 1 ; 王文娟 1 ; 高苗苗 1 ; 陈银华 1 ; 于晓惠 1 ;

作者机构: 1.海南省热带生物资源可持续利用重点实验室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 木薯;FER基因;生物信息学分析;非生物胁迫

期刊名称: 热带亚热带植物学报

ISSN: 1005-3395

年卷期: 2024 年 003 期

页码: 435-445

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 植物铁蛋白(Ferritin, FER)既能存储铁,又能响应各种非生物胁迫。该研究基于全基因组水平对木薯(Manihot esculenta)的FER基因家族进行分析,结果表明,从木薯中共鉴定到4个FER基因,根据系统发育树将木薯FER基因划分为2支,所有成员均包含Euk_Ferritin的功能结构域并位于叶绿体内。木薯FERs基因位于LG7~LG10染色体上;基因共线性分析表明,共有3对潜在的复制基因对,无串联重复事件;Ka/Ks值表明,MeFER同源基因经过了纯化选择;该家族含有响应激素和胁迫诱导的顺式作用元件;q RT-PCR分析表明,MeFER基因的表达具有组织特异性,MeFER4基因响应多种胁迫,且在干旱胁迫下响应最为显著。该研究为木薯FER基因家族的功能研究奠定了基础。

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