文献类型： 中文期刊
作者： 官玲亮 1 ; 查英 1 ; 白琳 1 ; 于福来 1 ; 陈振夏 1 ; 陈晓鹭 1 ; 谢小丽 1 ; 王凯 1 ; 黄梅 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/海南省艾纳香工程技术研究中心
关键词： 艾纳香;MYB转录因子;生物信息学
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2020 年 007 期
页码： 1305-1312
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： MYB转录因子是植物中庞大的转录因子家族之一,在植物体内有着广泛的生物学功能.基于艾纳香全长转录组数据库,利用DNAMAN 6.0、MEGA 5.05软件以及ProtParam、WebLogo和SOPMA在线网站分析艾纳香MYB转录因子家族蛋白的分类、理化性质、氨基酸序列高级结构、保守结构域、系统进化等.结果表明,挖掘到127个BbMYB基因,预测47条具有MYB转录因子保守结构域的蛋白序列;根据结构域可分为1R-BbMYB和R2R3-MYB 2个亚类,其中R2-BbMYB与R3-BbMYB基序中都含有3个保守的色氨酸,而R1-BbMYB基序只有2个保守的色氨酸;艾纳香MYB家族蛋白均为亲水性蛋白,热稳定性较高且富含碱性氨基酸,大部分蛋白以无规则卷曲为主,其中R2R3-BbMYB3、R2R3-BbMYB4与1R-BbMYB15蛋白是以α-螺旋为主;与拟南芥MYB转录因子家族共同构建的进化树发现,艾纳香MYB家族在进化上包括2个大类,6个亚类,通过艾纳香与拟南芥MYB蛋白序列相邻或是进化关系近可以预测艾纳香MYB基因功能,为进一步对艾纳香MYB家族基因研究及其功能鉴定提供科学依据.
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