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木薯干旱胁迫下甲基化变化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 冯素彬 1 ; 邹枚伶 2 ; 张圣奎 3 ; 夏志强 2 ; 王文泉 2 ;

作者机构: 1.海南大学农学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物基因组与基因资源研究室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.海南大学农学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 木薯;DNA甲基化;AFSM;干旱胁迫

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2017 年 04 期

页码: 1492-1498

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 研究了两个个体特征差异较大且面对干旱有不同响应机制的木薯品种SC124和Arg7,比较了在干旱处理3 d、12 d、18 d后DNA甲基化的变化情况,探究DNA甲基化在木薯抵御干旱胁迫中的作用。利用全基因组甲基化检测技术扩增片段单核苷酸多态性位点和甲基化位点(AFSM)检测基因组上的DNA甲基化水平变化情况。根据AFSM建库标准构建了测序文库,并对文库进行了质量检测。根据AFSM测序数据分析表明,木薯基因组中叶片的甲基化比例为5.9%~28.6%,根的甲基化比例为4.1%~13.5%。干旱胁迫使植株甲基化总体水平产生变化,并且具有组织和时空特异性。木薯面对干旱胁迫根据品种的不同,DNA甲基化具有不同的相应特点,且和处理时期和组织部位相关。

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