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几种尖孢镰刀菌专化型中SIX1、SIX4、SIX6、SIX8同源基因分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨腊英 1 ; 郭立佳 1 ; 刘磊 1 ; 梁昌聪 1 ; 汪军 1 ; 王国芬 1 ; 陈平亚 1 ; 黄俊生 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业部热带农林有害生物入侵检测与控制重点实验室

关键词： 尖孢镰刀菌专化型;效应基因;香蕉枯萎病菌;分子鉴定

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2015 年 08 期

页码： 1739-1746

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 尖孢镰刀菌在与寄主的相互作用中分泌几个特定的富含半胱氨酸的小分子量蛋白进入木质部中启动致病力,被称为SIX(secreted in xylem)蛋白,为明确其在不同寄主中的作用,本研究比较分析了几种尖孢镰刀菌专化型中SIX1、SIX4、SIX6、SIX8同源基因序列。根据已完成的尖孢镰刀菌古巴专化型1号(Foc1)与4号生理小种(Foc4)全基因组测序序列信息及相关SIX基因序列设计引物,应用PCR方法扩增分析56株尖孢镰刀菌古巴专化型与18株其它专化型及非致病型尖孢镰刀菌菌与其它种或属共21株菌株中的SIX1、SIX4、SIX6、SIX8基因。结果表明:设计的SIX1、SIX4、SIX6、SIX8基因引物均不能从非致病性尖孢镰刀菌与其它镰刀属种或其它属的菌株DNA中扩增出目的条带;SIX1基因的2个引物均能从供试的Foc菌株DNA中扩增出目的条带,同时可从部分其它专化型菌株DNA中扩增出目的条带;SIX4基因引物仅能从供试的尖孢镰刀菌番茄专化型与部分甘蓝专化型菌株DNA中扩增出目的条带;SIX6引物仅能从供试Foc1、Foc2、Foc4菌株DNA中扩增出目的条带;SIX8基因引物能从所有供试的致病尖孢镰刀菌中DNA扩增出目的条带。研究发现的SIX6基因序列提供了快速鉴定尖孢镰刀菌古巴专化型的检测方法,同时为深入研究尖孢镰刀菌各个专化型中SIX基因的功能奠定基础。

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