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五指山猪线粒体基因组全序列测定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 于萍 1 ; 曹婷 1 ; 赵春萍 1 ; 刘雅芳 2 ; 施力光 1 ; 张立岭 2 ; 侯冠彧 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

2.海南大学农学院

关键词： 五指山猪;线粒体基因组;蛋白质编码区;控制区

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2015 年 24 卷 07 期

页码： 16-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR及TA克隆测序技术,获得五指山猪线粒体基因组全序列(KJ909516),并对其特征进行具体分析。结果表明,五指山猪线粒体基因组序列全长16 689bp,碱基组成为A(34.7%)、C(26.2%)、G(13.3%)、T(25.8%),包含13个蛋白编码区,2个rRNA,22个tRNA和1个非编码控制区(D-Loop区)。13个蛋白质编码基因中,ND2、ND3和ND5起始密码子为ATA,ND4L起始密码子为GTG,其余均为ATG。蛋白编码基因ND1和ND2终止密码子为TAG,Cyt b终止密码为AGA,COXⅡ、COXⅢ、ND3和ND4的终止信号为不完全密码子T,其余均为TAA。22个tRNA中除tRNASer(AGY)缺少DHU臂外,其余tRNA均可形成典型三叶草结构。线粒体控制区全长1 254bp,含有22个长度为10bp的串联重复序列ACGTGCGTAC。5种中国小型猪蛋白质编码基因的比对结果说明,五指山猪在ND2和ND5基因上与其他4个猪种存在明显差异,可为能量代谢差异研究提供分子学依据。

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