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玉米转录因子NF-YB基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐志军 1 ; 刘洋 2 ; 徐磊 2 ; 安东升 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院

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关键词： NF-YB基因家族;理化性质;基因结构;启动子;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2019 年 012 期

页码： 3807-3816

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示玉米NF-YB基因家族的功能,本研究利用生物信息学手段,鉴定了玉米NF-YB基因家族,并系统的分析了该基因家族各蛋白的理化性质、基因的染色体定位、保守结构域、基因结构、系统进化、磷酸化位点、启动子和基因组织表达.结果表明:玉米基因组中含有21个NF-YB基因,所编码的蛋白质均位于细胞核,且不含有跨膜结构.这些基因不均匀地分布于玉米的9条染色体上,均含有高度保守的结构域CBFD_NFYB_HMF,系统进化分析将其分为3类.磷酸化位点分析表明,玉米NF-YB家族存在着大量的磷酸化位点.启动子分析表明,基因家族启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件.组织表达分析发现,至少有18个基因可以进行表达,其中有5个基因表现出组织特异性,不同基因在不同组织、不同时期的表达具有时序性.玉米NF-YB基因家族核心结构域的保守性、基因功能的分化、启动子序列中的大量逆境相关元件、基因表达的差异性,可能都是玉米更好调控自身生长发育和适应逆境的结果.研究结果为进一步解析玉米NF-YB基因家族的功能提供参考.

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