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霍山石斛PMM基因的克隆及其表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林榕燕 1 ; 钟淮钦 1 ; 叶秀仙 1 ; 黄敏玲 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心

关键词： 霍山石斛;PMM基因;克隆;qPCR

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 2326-2333

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究磷酸甘露糖变位酶基因(PMM)的功能及其在多糖生物合成中的表达调控机制,以霍山石斛原球茎为材料,利用RT-PCR技术,克隆PMM基因,对其cDNA序列和表达情况进行分析。结果显示:霍山石斛PMM基因cDNA序列长949 bp,包含一个747 bp的开放阅读框,共编码248个氨基酸,GenBank中的登录号为KY912084。生物信息学分析表明:该蛋白属于HAD超家族,可能是一种稳定的、不具有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白。系统进化树分析表明,霍山石斛PMM与铁皮石斛、海枣、油棕、芦笋亲缘关系较近,处于同一分支。qPCR结果显示:PMM基因在茎中的相对表达量最高;在4种不同药用石斛比较中,鼓槌石斛的相对表达量最高,霍山石斛的表达量最低。本研究结果表明PMM基因可能不仅参与到石斛多糖的合成,还与其它化合物的生物合成相关。

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