文献类型： 中文期刊
作者： 胡小文 1 ; 姚艳丽 1 ; 邢淑莲 1 ; 徐磊 1 ; 刘洋 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站
关键词： 甘蔗;割手密;斑茅;Ⅲ型过氧化物;基因克隆
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2015 年 13 卷 10 期
页码： 2340-2347
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 研究旨在通过比较分析甘蔗及其近缘种割手密和斑茅Ⅲ型过氧化物酶(Prxs)基因差异,探讨这三种植物Prxs功能差异的遗传基础。采用同源克隆方法,成功克隆获得了甘蔗、斑茅和割手密的Prxs基因DNA序列(Genebank登录号分别为KJ001797,KJ001798和KJ001799)。经测序鉴定,克隆获得的这三个基因DNA长度分别为3 030 bp、3 048 bp和3 028 bp,外显子长度均为1 083 bp,其中编码区长度为996 bp,编码331个氨基酸。蛋白质保守结构域分析表明,此三个基因均具有过氧化物酶典型保守结构域,属于依赖于亚铁血红素Ⅲ型过氧化物酶亚类,为目标基因,且在功能位点区域高度保守,只存在一个氨基酸位点差异。基因结构比较分析表明,克隆获得的割手密、斑茅和甘蔗过氧化物酶基因均包含4个外显子,与高粱、玉米和水稻的同源基因外显子个数一致,外显子长度有较小差异,而内含子长度却存在较大差异。高粱、玉米和水稻Prxs同源基因均处在靠近染色体末端的位置,说明此基因存在一定的同线性。本研究结果为深入研究Prxs基因在不同植物中功能差异提供了一定的参考,为研究植物中Prxs基因的进化规律奠定了一定的基础。
- 相关文献
[1]水分胁迫对甘蔗、割手密和斑茅抗氧化酶活性的影响. 姚艳丽,邢淑莲,徐磊,胡小文,刘洋. 2013
[2]海南甘蔗野生种资源的收集与遗传多样性初析. 刘洋,刘新龙,苏火生,刘洪博,姚艳丽,苏俊波. 2013
[3]甘蔗和斑茅Ⅲ型过氧化物酶基因(SoPOD-1和SaPOD-1)cDNA克隆与分析. 胡小文,姚艳丽,邢淑莲,徐磊,刘洋. 2015
[4]低温胁迫等对割手密和斑茅叶片游离脯氨酸含量的影响. 丁灿,杨清辉,李富生,林位夫. 2005
[5]低温胁迫对割手密和斑茅游离脯氨酸含量的影响(Ⅱ). 丁灿,杨清辉,李富生,林位夫. 2006
[6]斑茅过氧化氢酶基因(EaCAT-1a)克隆与序列分析. 刘洋,姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,张树珍. 2015
[7]斑茅铜锌超氧化物歧化酶基因(SaSOD-1)的克隆与序列分析. 姚艳丽,邢淑莲,胡小文,徐磊,刘洋. 2015
[8]割手密鸟氨酸转氨酶(Ssδ-OAT-2)基因的克隆与表达分析. 姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,高玉尧,安东升,刘洋. 2018
[9]割手密铜锌超氧化物歧化酶基因(SsSOD-1a)的克隆与分析. 姚艳丽,胡小文,邢淑莲,徐磊,张树珍. 2015
[10]割手密过氧化氢酶基因(SsCAT-1)的克隆与比较分析. 刘洋,姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,张树珍. 2014
[11]割手密SsREMO-1基因的克隆与等位变异分析. 刘洋,姚艳丽,胡小文,徐磊,高玉尧,安东升. 2018
[12]割手密DREB2类转录因子的克隆与比较分析. 姚艳丽,徐磊,胡小文,邢淑莲,刘洋. 2016
[13]割手密过氧化物酶基因(SsPOD-1)cDNA克隆与功能分析. 胡小文,姚艳丽,邢淑莲,徐磊,刘洋. 2015
[14]割手密2个DREB2基因的克隆与比较分析. 姚艳丽,胡小文,徐磊,邢淑莲,刘洋. 2016
[15]斑茅铜锌超氧化物歧化酶基因(SaSOD-1)的克隆与比较分析. Yao Yanli,姚艳丽,Xing Shulian,邢淑莲. 2014
[16]甘蔗液泡膜二羧酸转运蛋白基因ScTDT克隆与表达分析. 冯小艳,王俊刚,赵婷婷,彭李顺,王文治,冯翠莲,沈林波,张树珍. 2021
[17]甘蔗铁氧还蛋白基因cDNA的克隆及序列分析. 宋喜梅,黄峰,姚全胜,郑良永,陈由强. 2011
[18]甘蔗分子伴侣ShDnaJ基因克隆及在甘蔗线条花叶病毒胁迫下的表达分析. 冯小艳,王文治,王俊刚,沈林波,赵婷婷,冯翠莲,张树珍. 2023
[19]甘蔗新基因ShHXT4克隆亚细胞定位及表达特征. 王俊刚,马晓雯,赵婷婷,杨本鹏,王文治,蔡文伟,冯翠莲,曾军,熊国如,张树珍. 2017
[20]甘蔗ACC氧化酶基因片段的克隆与序列分析. 李杨瑞,张树珍,林俊芳,郭丽琼. 2003
作者其他论文 更多>>
-
国外引进花生资源的遗传多样性分析和指纹图谱构建
作者：张雪姣;王丽媛;李启彪;徐磊;季木灯;江日东;徐志军
关键词：花生;种质资源引进;表型评价;SNP;遗传多样性
-
砂仁叶位叶绿素荧光特性及品种光合能力分析
作者：谢瑞红;姚艳丽;安东升;卢碧莹;李妍慧;李文秀;贺军军
关键词：砂仁;叶位;叶绿素荧光;光合能力
-
甘蔗新品种的光合表型与叶片表征对干旱胁迫及复水的响应
作者：安东升;赵宝山;刘洋;严程明;孔冉;黄文甫;苏俊波
关键词：甘蔗;耐旱;干旱胁迫;复水;光合表型;叶片表征
-
生物炭耦合芽孢杆菌对小白菜根际养分及细菌群落的影响
作者：李启彪;张雪姣;徐磊;胡永华;徐志军
关键词：小白菜;根际促生菌;炭基菌肥;固氮;冗余分析
-
3个美国油梨品种在广东湛江引种表现评价
作者：朱利飞;刘丽琴;郑雪文;胡小文;杨转英
关键词：油梨;Hass;引种;花期;花粉萌发率;单果质量
-
甘蔗高光效新品种筛选与光合潜力分析
作者：安东升;聂虎子;刘洋;赵宝山;严程明;孔冉;苏俊波
关键词：甘蔗;高光效;新品种;筛选;光合潜力
-
菠萝AcNINV家族全基因组分离及表达分析
作者：吴建阳;陈妹;姚艳丽;张秀梅
关键词：菠萝（Ananas comosus）;蔗糖含量;碱性/中性转化酶;基因家族;基因表达
