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香蕉枯萎病菌pacC基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李松伟 1 ; 黄俊生 1 ; 羊玉花 1 ; 杨歆璇 1 ; 贾慧升 1 ; 杨腊英 1 ; 王国芬 1 ; 方晓东 2 ; 李传东 1 ;

作者机构: 1.海南大学

2.深圳华大基因研究院

关键词: 尖孢镰刀菌;生理小种;pacC基因;致病力

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2010 年 31 卷 12 期

页码: 2159-2165

收录情况: CSCD

摘要: 采用PCR和RT-PCR方法扩增尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f sp.cubense,FOC)1号和4号生理小种的pacC基因(FOC1-pacC,FOC4-pacC),对FOC1-pacC和FOC4-pacC相似序列进行搜索和比对,以及对基因编码蛋白进行结构预测,发现FOC1-pacC和FOC4-pacC开放阅读框分别为1 863、1 905 bp,编码634、620个氨基酸,2个小种之间基因序列和氨基酸序列差异明显,FOC1-pacC比FOC4-pacC缺少1个基因片段,FOC-pacC与其相似序列有显著差异,比对缺少2个基因片段;初入侵转录组表达分析说明,2生理小种pacC基因在小种侵染不同品种香蕉过程中表达有差异,FOC1-pacC基因只在粉蕉中检测到表达,而FOC4-pacC则在粉蕉和香蕉中都检测到表达,但在粉蕉中的表达量明显高于香蕉。

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