文献类型： 中文期刊
作者： 张杰伟 1 ; 秦新月 1 ; 陈亚娟 1 ; 刘婧 1 ; 崔进荣 1 ; 姚磊 1 ; 魏建华 1 ;
作者机构： 1.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;北京农学院植物科学技术学院;内蒙古师范大学生命科学与技术学院
关键词： 谷子;eIF5A;基因家族;进化分析
期刊名称： 西南农业学报
ISSN： 1001-4829
年卷期： 2018 年 07 期
页码： 1333-1337
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】本文系统分析了谷子e IF5A基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】利用谷子基因组数据库,运用生物信息学方法,鉴定谷子e IF5A基因家族的基因结构、染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】谷子含有4个e IF5A基因,均含有4个内显子,分布于谷子的3条染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子e IF5A蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287)。磷酸化位点预测分析表明谷子e IF5A蛋白均含有大量潜在磷酸化位点。【结论】以上结果将为今后揭示谷子e IF5A蛋白功能提供重要的线索。
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