文献类型: 中文期刊
作者: 王树昌 1 ; 于晓玲 2 ; 李淑霞 2 ; 阮孟斌 2 ; 彭明 3 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
2.;中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
3.;中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所;
关键词: 木薯;MeHDS09;逆境胁迫;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 热带生物学报
ISSN: 1674-7054
年卷期: 2017 年 04 期
页码: 409-414
摘要: 为研究MeHDS09基因的结构与功能,及其在木薯抵御不同逆境胁迫中的作用。笔者基于木薯转录组数据及全基因组公共数据库,采用RT-PCR手段获得2 151 bp,具有完整ORF的MeHDS09基因,其编码716个氨基酸,蛋白质相对分子质量为81.3 k D;生物信息学分析结果显示,该蛋白无信号肽位点,具有线粒体靶向肽,主要定位于线粒体。序列分析结果显示,MeHDS09基因序列与大豆中增强抗病性的蛋白2基因具有较高的同源性;其上游启动子区序列除含有启动子核心元件外,还具有抗病、激素应答等反应元件,此结果暗示MeHDS09基因的表达可能受外界环境因素的影响。进一步利用qRT-PCR分析表明:MeHDS09基因对GA/IAA反应不灵敏;低温、ABA、JA处理可显著诱导木薯中MeHDS09的表达,而高温和SA处理则显著抑制了MeHDS09的表达。综上所述,MeHDS09可能在木薯抵御低温等逆境胁迫反应中起作用。本研究结果为研究MeHDS09基因的生物学功能及其应用奠定了基础。
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