您好,欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库!

木薯乙烯信号途径重要基因的生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 任梦云 1 ; 冯仁军 2 ; 史后蕊 3 ; 云天艳 3 ; 张恒 3 ;

作者机构: 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.中国热带农业科学院热带生物技术研究所、农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词: 木薯;乙烯信号途径;生物信息学分析;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2014 年 12 卷 03 期

页码: 33-43

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 木薯是全球三大薯类作物之一,具有抗逆、耐瘠的特性。气态植物激素乙烯在植物生长发育和应对生物及非生物胁迫过程中起着重要作用。本研究收集了木薯乙烯信号途径中的受体基因家族(MeERS1,MeERS2,MeERS3,MeERS4,MeERS5,MeETR2和MeEIN4)和部分转录因子基因家族(MeEIL1,MeEIL2),通过生物信息学方法对这些基因进行了多重比对、保守结构域预测和聚类分析,并采用实时荧光定量PCR的方法测定它们在木薯华南五号不同组织器官中的转录表达水平。生物信息学分析结果表明,受体蛋白都含有高度保守的GAF和HisKA结构域,而转录因子则含有EIN3结构域。另外,受体蛋白都具有跨膜结构域,有的还具有信号肽,而转录因子不具有这些结构域。转录表达分析结果表明,MeERS1、MeERS3、MeEIN4和MeEIL2成组成型表达,在茎、根、块根和叶中没有明显的表达差异;而另一部分基因则成组织器官差异型表达,其中MeERS2和MeETR2主要在茎和叶中高表达,MaERS4、MaERS5和MaEIL1主要在根、茎和叶中表达,在块根中表达量较低。这些结果将为进一步研究乙烯信号途径在木薯抗胁迫过程中的功能奠定基础。

  • 相关文献

[1]木薯MeHDS09基因克隆及其对逆境信号的响应. 王树昌,于晓玲,李淑霞,阮孟斌,彭明. 2017

[2]木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析. 李建君,郭鑫,林晨俞,王文娟,高苗苗,陈银华,于晓惠. 2024

[3]木薯转化酶抑制子MeINH3基因的克隆及生物信息学分析. 吴晓慧,耿梦婷,范洁,姚远,符少萍,胡新文,郭建春. 2014

[4]玉米蔗糖合成酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈曙,赵秋芳,陈宏良,金辉. 2019

[5]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020

[6]香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析. 史后蕊,冯仁军,王静毅,柴娟,任梦云,卢利方,张银东. 2014

[7]香蕉NPR1基因家族的鉴定及在枯萎病菌胁迫下表达分析. 任陪娣,谢碧玉,陈翠,贾彩红,王静毅,张建斌,徐碧玉,王卓,金志强. 2019

[8]芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析. 罗睿雄,赵志常,黄建峰,党志国,高爱平. 2016

[9]橡胶树HbLPAT2基因的克隆与表达分析. 王晓琳,曲鹏,甘明洋,仇键,范睿深. 2024

[10]橡胶树HbWRI转录因子的克隆与表达分析. 范睿深,白楠芳,唐霁月,曲鹏,高宏华,魏芳,杨文凤,吴明,仇键. 2024

[11]木薯ETR1基因克隆及表达分析. 陈志晟,颜彦,赵思涵,田丽波,商桑,胡伟. 2020

[12]木薯MeASR3基因的克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2019

[13]木薯海藻糖合成酶基因MeTPS6克隆及其在非生物胁迫下的表达分析. 丁泽红,铁韦韦,付莉莉,颜彦,胡伟. 2017

[14]木薯MeCIPK1基因克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2018

[15]木薯MePYL8基因克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2018

[16]木薯MeHSF7基因克隆及表达分析. 曾坚,廖凤凤,吴春来,胡伟. 2020

[17]木薯FRK1类似基因的分离及表达分析. 吴金山,陆小静,王思琦,黄家权,张逸杰,贾迎雪,陈银华. 2023

[18]木薯及其他植物P5CS基因进化及表达分析. 丁泽红,付莉莉,铁韦韦,颜彦,胡伟. 2017

[19]木薯MeNAC29、MeNAC30基因的克隆及表达分析. 林兆威,李超萍,时涛,王国芬,李博勋,蔡吉苗,黄贵修. 2019

[20]木薯CKX基因的序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯诱导表达特性. 丛汉卿,齐尧尧,朱文丽,陈松笔,李丽. 2016

作者其他论文 更多>>