文献类型： 中文期刊
作者： 姜翠翠 1 ; 陈桂信 1 ; 潘东明 1 ; 赖燕 2 ; 郑鸿昌 1 ;
作者机构： 1.福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所
2.福建农林大学生命科学学院
关键词： (木奈);褐变;均一化全长cDNA文库;表达序列标签
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2013 年 34 卷 02 期
页码： 91-95
收录情况： CSCD
摘要： 以发生褐变初期的(木奈)果肉总RNA为材料,对SMARTTMcDNA合成方法进行改良,并将长距离PCR、DSN处理和定向克隆相结合,成功构建(木奈)褐变果实均一化全长cDNA文库。经检测,该文库的初始滴度为2.0×106pfu/mL,重组率为99%,插入片段大小平均为1.8 kb,文库质量良好。随机挑取720个阳性克隆进行5′EST测序,共获得684条有效的ESTs序列;并将684条有效序列拼接后,58条被组装成21个重叠群(contigs),单拷贝(singlets)基因有626条,共得到647个单基因簇(unigenes),文库冗余率为8.4%。用Blast 2 go在线软件对测序结果进行功能注释和归类分析,结果显示,已知功能基因与能量代谢、蛋白质合成与降解、次生代谢物质、细胞壁代谢和转录因子有关。该文库的构建有利于从分子水平上研究(木奈)果实褐变发生的机制。
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