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水稻紫色颖壳突变体的转录组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡昌泉 1 ; 林觅 1 ; 颜静宛 1 ; 林智敏 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院生物技术研究所

关键词: 水稻;紫壳;花青素;转录组

期刊名称: 福建农业科技

ISSN: 0253-2301

年卷期: 2022 年 002 期

页码: 20-25

摘要: 鉴定水稻花青素新基因及揭示其代谢机制,用于水稻新品种选育,是创制功能性水稻的手段之一。为探讨水稻紫色颖壳形成对花青素积累代谢途径的作用,以从水稻籼稻转化体组织培养中筛选获得的1个紫色颖壳杂合突变体(PiX)为材料,采用Illumina HiSeqTM 6000高通量转录组学(RNA-Seq)技术对其自交获得的突变型、正常型及野生型进行转录组测序研究。结果表明:突变型(ME)与野生型(F8)相比上调基因5 108个、下调基因4 288个,自交分离正常表型(PD)与野生型(F8)相比上调基因4 653个、下调基因4 397个,自交分离正常表型(PD)与突变型(ME)相比上调基因2 078个、下调基因2 829。GO功能富集分析表明水解酶活性类基因差异表达变化显著;KEGG Pathway分析结果表明,与野生型相比,在类黄酮生物合成途径中,突变型中与类黄酮合成相关色素基因数量多,且主要受编码查尔酮异构酶OsCHI影响。该研究结果可为研究水稻花色苷积累的分子机制提供参考。

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