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基于5.8S rDNA和ITS序列探讨亚洲瓠瓜的地理分化

文献类型: 中文期刊

作者: 周先治 1 ; 陈阳 2 ; 陈晟 2 ; 吴宇芬 2 ; 赵依杰 2 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院农业生物资源研究所

2.福建省农业科学院农业生物资源研究所;福州市农业科学研究所

关键词: 5.8S rDNA;亚洲瓠瓜;内转录间隔区;地理分化

期刊名称: 中国蔬菜

ISSN: 1000-6346

年卷期: 2011 年 1 卷 06 期

页码: 49-53

收录情况: 北大核心

摘要: 基于5.8S rDNA及ITS序列对23份来自中国、泰国和日本的亚洲瓠瓜品种进行了地理分化研究。结果发现,23份瓠瓜材料的ITS1+5.8S rDNA+ITS2序列的长度在611~627bp之间,G+C含量在54.17%~63.26%之间,信息位点数65个,占总碱基数的11.09%;源自日本的2份瓠瓜品种的序列长度短于其他21份瓠瓜品种,G+C含量也明显低于其他瓠瓜品种。从5.8S rDNA及ITS序列构建的系统树可以看出,源自日本的瓠瓜品种与源自中国和泰国的瓠瓜品种存在地理分化现象,分属于不同的分支,支持率达到99%。序列间的同质性检验结果显示,2份源自日本的瓠瓜品种与源自中国和泰国的瓠瓜品种差异显著。

  • 相关文献

[1]番石榴焦腐病菌LAMP检测方法的建立及应用. 吴敏亮,张溢溪,兰成忠,刘裴清,李本金,陈庆河,翁启勇. 2013

[2]基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育. 吴宇芬,周先治,陈晟,陈阳,赵依杰. 2010

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