文献类型： 中文期刊
作者： 赵秋芳 1 ; 马海洋 2 ; 陈曙 2 ; 陈宏良 2 ; 贾利强 3 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室
2.;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室
3.;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所;农业部热带果树生物学重点实验室;
关键词： 番茄;泛素活化酶基因;进化分析;基因表达
期刊名称： 热带作物学报
ISSN： 1000-2561
年卷期： 2017 年 06 期
页码： 1081-1087
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 泛素活化酶是蛋白泛素化所需的第一个酶,在泛素蛋白酶体途径中发挥重要作用。本文利用生物信息学方法从番茄基因组中鉴定出2个泛素活化酶(ubiquitin activating enzyme,UBA)基因,命名为Sl UBA1和Sl UBA2。序列分析表明Sl UBA1和Sl UBA2基因的CDS序列长分别为3 060和3 255 bp,分别编码1 019和1 084个氨基酸,编码蛋白分子量为114.15和120.46 ku,分别位于第6和9染色体。2个基因均含有5个内含子,编码蛋白均为酸性、疏水性蛋白;对蛋白二级结构分析发现2个UBA蛋白均以α-螺旋和无规则卷曲为主;亚细胞定位预测均定位于细胞核。序列比对和进化树分析表明番茄UBA基因与其他物种UBA基因相似性高,进化过程非常保守。番茄不同组织表达分析结果表明2个UBA基因在根系和花的表达量较高,果实成熟过程中的表达量相对较低。非生物胁迫试验结果表明:Sl UBA1基因在低温、干旱和盐胁迫下均上调表达;而Sl UBA2基因对非生物胁迫没有明显响应,这些结果表明Sl UBA1基因可能参与番茄对低温、干旱和盐胁迫的响应。
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