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蓖麻基因组中一种Mutator-like类型MITEs元件的结构分析和鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 周新成 1 ; 王海燕 1 ; 胡梅珍 1 ; 李正绪 1 ; 卢诚 1 ; 王文泉 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： MITEs;Mutator-like;蓖麻;转座子

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2012 年 33 卷 02 期

页码： 327-331

收录情况： CSCD

摘要： 利用生物信息学方法,对蓖麻基因组Mutator-like类型MITEs元件进行了分析和鉴定。结果表明,蓖麻基因组上共鉴定出76个小于3 kb的Mutator-like类型MITEs元件,其中长度小于1 000 bp的元件有53个,占69.7%。这些MITEs元件中有42个位于基因间隔区,11个位于基因内含子区,位于5'UTR和3'UTR区的分别有8个和4个,另有1个位于基因编码区。29个MITEs元件带有转座酶以外的功能基因片段,成为pack-MITEs。多个pack-MITEs带有相同的非转座酶基因片段。Mutator-like类型的MITEs对蓖麻基因的表达和基因组的进化有潜在的影响,值得深入分析。

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[3]蓖麻LEA基因家族的全基因组鉴定、分类及其进化分析. 邹智,黄启星,安锋. 2013

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[5]蓖麻根际土壤解钾菌的筛选鉴定及发酵条件的优化. 张妙宜,陈宇丰,周登博,起登凤,高祝芬,张锡炎. 2016

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[9]蓖麻WRKY转录因子的全基因组鉴定及其进化分析. 邹智. 2013

[10]蓖麻WRKY基因的电子克隆及其生物信息学分析. 杨鹏雅,李开绵,周建国,王文泉. 2009

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