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福建省番茄黄化曲叶病毒分子鉴定及序列分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 张前荣

作者： 张前荣 1 ; Zhang Qian-rong 2 ; Ye Xin-ru 3 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所,福建 福州 350013

2.福建省农业科学院蔬菜研究中心,福建 福州 350013

3.福建省蔬菜工程技术研究中心,福建 福州 350013

关键词： 番茄黄化曲叶病;病原菌;分子鉴定;序列分析

会议名称： 第十八届福建省科协年会农业分会暨福建省农学会学术年会

主办单位： 福建省科协`福建省农学会

页码： 00000220-00000228

摘要： 本研究采集了福建省5个地市发生的番茄黄化曲叶病毒病病样,对其病原菌进行分子鉴定以及基因组序列的变异和进化情况进行分析.利用双生病毒简并引物TYLCVF/TYLCVR,对采集的5个地市的病样进行检测,5个病样均扩增得到约541bp的片段,比对分析表明其为番茄黄化曲叶病毒的部分片段.根据该特异性片段序列设计一对克隆全长的相邻背向引物TYLCVQCF/TYLCVQCR,对样品进行DNA-A基因克隆和序列测序,同时利用双生病毒的DNA-B的通用引物DNAB-F/DNAB-R和DNAβ通用引物DNAβ-F/DNAβ-R对病样进行进行PCR扩增.结果表明5个病样的DNA-A全长分别为2774bp、2775bp、2774bp、2773bp,编码6个蛋白.经比对分析发现,福建省危害的TYLCV的DNA-A与TYLCV-Israel株系相似性为99.0％.基因组序列系统进化分析表明,福建省病毒分离物与河南分离物(Gen Bank登录号:JQ038235.1)、辽宁分离物(Gen Bank登录号:KJ754189.1)等序列相似性很高,均属于TYLCV-Israel分支.样品中未检测到DNA-B.仅在福州市的分离物中检测到1349bp的DNA-β卫星,经比对分析发现DNA-β变异较大,其与台湾(Gen Bank登录号:AJ542495.1)相似度高达98.7％.,而印度尼西亚分离物02(Gen Bank登录号:AB113651.1)相似度仅83.4％.

分类号： S436.412

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