科研产出
水稻粒长新基因GL12-1定位与利用分析
《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：水稻的粒长是水稻粒型构成的因素之一，直接影响水稻的单产，而粒长又是稻米品质的重要指标之一。该研究利用选育含有稻瘟病抗性基因Pigm-1的长粒恢复系R20-4为研究材料，通过图位克隆的方法，对粒长基因进行鉴定，并对该长粒性状在育种中的应用进行了分析。结果显示：（1）该长粒为显性基因控制的性状。（2）将粒长基因GL12-1初步定位在水稻第12染色体上Indel-12-3和Indel-12-7之间，物理距离约4.5 Mb。（3）通过进一步开发标记，最终将该粒长基因GL12-1定位在标记Indel-10和Indel-16之间，物理距离约900 kb。（4）长粒恢复系R20-4与‘庆源A’、‘定源A’和‘启源A’测交组合的粒长均表现R20-4表型，而与‘靓香A’测交组合的粒长比R20-4更长。研究表明，粒长基因GL12-1为显性基因控制的性状，可能为一个新的粒长控制基因，该研究为后期GL12-1基因的克隆、功能研究以及粒型分子育种奠定了基础。
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荔枝霜疫霉自噬相关基因的鉴定与表达分析
《植物病理学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：细胞自噬(Autophagy)是一种真核生物中高度保守的胞内物质降解和循环再利用的生理过程,其调控细胞动态平衡、压力适应和细胞程序性死亡,与植物病原真菌生长发育、孢子形成、侵染等一系列过程密切相关.荔枝霜疫霉(Peronophy-thora litchii)侵染引起的荔枝霜疫病严重危害荔枝生产及采后贮藏.本研究利用模式物种中已知的自噬相关蛋白,采用同源比对的方法在荔枝霜疫霉基因组数据库中鉴定到19个同源蛋白,分属16种蛋白类型.分析基因结构和蛋白保守功能域,发现荔枝霜疫霉自噬相关基因均具有内含子,且数目差异明显;所鉴定候选蛋白都具有相应分组的保守功能域,而PlATG1a在C端具有2个额外的ATG11功能域,P1ATG11则在其N端包含1个APG17功能域.进一步对具有核心功能且多成员的自噬相关蛋白ATG1、ATG6、ATG8和ATG18进行系统进化和序列模块分析发现,这些蛋白在不同物种之间十分保守,但是其同源蛋白间存在分化.通过转录组数据分析和qRT-PCR验证结果显示,荔枝霜疫霉中自噬相关基因在生长发育和侵染阶段均有表达,与菌丝阶段相比,PlATG1a、PlATG2、PlATG3、PlATG6a、PlATG8、PlATG18a基因在游动孢子阶段特异上调表达,其中PlATG8最为显著;PlVPS34在孢子囊阶段特异诱导表达,PlATG1b、PlATG12、PlATG17在孢子囊与游动孢子阶段上调表达但是在侵染阶段下调表达;PlATG6b、PlATG9、PlATG10、PlATG13、PlATG14及PlVPS15基因在生长发育和侵染阶段均表现出不同程度的上调表达,PlATG7、PlATG11、PlATG18b则在侵染阶段显著下调表达.结果表明,细胞自噬可能参与调控荔枝霜疫霉的生长发育及致病过程.
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宁化茶产业SWOT分析及其发展策略研究
《中国农学通报 》 2022 CSCD
摘要：宁化县是全国的产茶重点县,茶产业是宁化县的特色产业,目前存在着品牌影响力不强、企业竞争力弱、全产业链发展不均衡、三产融合程度不高的问题.本研究在调研宁化茶产业基本情况的基础上,采用SWOT分析法,总结宁化县的区位、政策、生态与文旅资源优势,分析茶产业发展存在的不足与劣势,建议通过建设标准化茶园、大力推广宁化特色茶品种、打造5条"森林康养+红色+客家"茶文旅融合路线、提升宁化茶品牌水平等措施,促进宁化茶产业转型升级.
关键词： 宁化县 茶产业 SWOT分析 标准化茶园 智慧茶园 ’孔坑茶’ 茶文旅融合
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薏苡功能性酒研究进展及工艺优化
《现代农业科技 》 2022
摘要：本研究通过工艺流程优化,以薏苡的根、茎、叶,以及薏苡仁加工过程产生的碎薏米、麸皮等为原料,酿造富含薏苡素等功能性成分、具有保健功效的薏苡酒,并采用HPLC法对酿制的薏苡酒中的薏苡素含量进行测定,得到薏苡酒中薏苡素含量为25~60 mg/L.该方法提升了薏苡酒中功能成分薏苡素含量,也为薏苡的综合利用提供了有效途径.
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2株鸡传染性支气管炎病毒株的分离鉴定及其S1基因遗传进化分析
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]了解福建地区鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)的流行及其S1基因变异情况.[方法]对2021年在福建地区鸡群中分离的2株病毒,通过鸡胚致病性试验、电子显微镜观察及RT-PCR方法进行鉴定.对2株分离株的S1基因进行克隆、测序并利用生物学软件进行分析.[结果]分离到的2株病毒均为IBV,分别命名为FJ-NP01和FJ-FZ01;FJ-NP01株和FJ-FZ01株的S1基因全长分别为1629 nt和1620 nt,编码543 aa和540 aa.FJ-FZ01株的S1基因裂解位点为HRRRR,与基因型I分支所有参考毒株裂解位点一致;分离株FJ-NP01的S1基因裂解位点为HRRKR,与已报道的基因型ⅣIBV分离毒株的裂解位点不同,与基因型Ⅵ参考毒株TC07-2的裂解位点一致.FJ-NP01株和FJ-FZ01株之间的核苷酸和氨基酸同源性较低,分别为83.2%和79.6%;与中国使用的Mass型常规疫苗H120和H52核苷酸和氨基酸序列同源性仅为75.7%~76.3%和77.1%~83.5%.FJ-NP01株是由基因型Ⅳ毒株CK CH GD LZ12-4与基因型I毒株L-1148在S1基因处发生重组而产生的新毒株,其核苷酸序列1438~1506 nt与推测的亲本毒株CK CH GD LZ12-4同源性达97%,其他S1基因核苷酸序列与推测的亲本毒株L-1148同源性达95.9%.[结论]以上结果表明福建地区IBV流行较为复杂,现有Mass型疫苗在福建省可能起不到良好的免疫保护作用.
关键词： 鸡传染性支气管炎病毒 分离 鉴定 S1基因 序列分析
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有机管理模式对茶园土壤真菌群落结构及功能的影响
《茶叶科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：以两种不同管理方式(常规和有机种植)和3个坡位(上、中、下坡位)表层土壤(0~20 cm)为研究对象,通过野外调查、高通量测序、功能预测结合分子生态网络分析,研究管理方式和坡位对土壤真菌群落结构、功能特征和共发生网络的影响.研究结果表明,管理方式和坡位对土壤真菌α多样性指数影响不显著,且不存在交互作用.在门水平,管理方式及不同坡位样地的优势真菌均为子囊菌门、担子菌门和被孢霉门,管理方式没有改变土壤优势真菌的种类,但影响其相对丰度.主坐标分析(PCoA)显示,管理模式导致茶园土壤真菌群落组成发生明显改变,常规管理方式下不同坡位之间的土壤真菌群落结构有显著差异(P<0.05),而有机种植下不同坡位之间无显著差异(P>0.05).组间群落差异分析(LEfSe)表明,37个差异物种对管理方式非常敏感,不同管理方式富集了不同的真菌类群.共现性网络分析发现,有机茶园土壤真菌网络节点数、平均聚类系数、边数、网络中心性和网络密度均明显高于常规茶园,说明其生态网络结构更为复杂.不同处理茶园土壤真菌以腐生营养型为主(66.67%~70.18%),有机茶园土壤中内生-垃圾腐生-土壤腐生-未定义腐生真菌、木材腐生真菌和动物病原-内生-植物病原-未定义腐生真菌的丰度显著高于常规茶园,而未定义腐生真菌、植物病原真菌和动物病原-植物病原-未定义腐生真菌的丰度则显著降低.相关性分析和冗余分析结果表明,土壤全磷、有效磷、全钾、有机质、阳离子交换量和pH值是影响茶园土壤真菌群落结构的主要因子.综上所述,有机管理方式对茶园土壤真菌群落结构产生显著影响,提高了土壤有益真菌的数量(被孢霉属),增强了土壤真菌网络稳定性和抗干扰能力,降低了病原真菌的丰度(如拟盘多毛孢属和假拟盘多毛孢属等),具有良好的生态环境效应.
关键词： 管理方式 坡位 真菌群落结构 共现性网络分析 FUNGuild功能预测
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甘薯紫外光受体IbUVR8基因克隆及表达特性分析
《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：UVR8是植物唯一的UV-B紫外光受体,为深入研究甘薯UVR8的功能,该研究以叶菜型甘薯'福菜薯23号'为试验材料,采用CODEHOP结合RACE技术,设计简并引物,克隆得到甘薯UVR8全长cDNA序列,并命名为IbUVR8,利用qRT-PCR分析IbUVR8在非生物胁迫下的表达特性,并通过原核表达获取IbUVR8蛋白,为IbUVR8基因在甘薯花青素合成调控作用奠定理论基础.结果表明:(1)成功克隆获得甘薯IbUVR8基因(NCBI登录号KT749986),该基因全长开放阅读框为1329 bp,共编码了441个氨基酸,相对分子量为47 kD,理论等电点为5.72.(2)序列对比和进化分析结果显示,IbUVR8与番茄、马铃薯UVR8蛋白序列相似性高,进化相对保守.(3)qRT-PCR结果显示,IbUVR8基因在甘薯中具有组织特异性,表达量为叶片>茎>根;在低温、干旱和NaCl等非生物胁迫下,IbUVR8基因在3种不同叶色甘薯中均为上调表达;在激素GA3和重金属Cu2+胁迫下,IbUVR8基因在不同甘薯材料的表达趋势差异显著.(4)原核表达获得大小约为80 kD的IbUVR8-GST融合蛋白.研究认为,甘薯IbUVR8基因受低温、干旱和NaCl等胁迫影响,推测IbUVR8可能在甘薯抗逆胁迫信号通路中发挥调控作用.
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