科研产出
利用GFP荧光标记比较大丽轮枝菌对抗/感马铃薯品种的侵染过程
《植物病理学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为了对马铃薯黄萎病菌的系统侵染进行研究,本研究首先建立了用于观察大丽轮枝菌侵染马铃薯过程的培养皿滤纸体系,在此基础上利用带有GFP标记的大丽轮枝菌对不同抗性水平马铃薯根系侵染过程进行了比较研究,结果表明:马铃薯根系在浓度为10~7个·mL-1的大丽轮枝菌分生孢子液中浸泡处理2 h后,分生孢子可附着在抗/感马铃薯根系的根毛上,单个视野中感病品种根系上分生孢子附着平均数量为65个,显著高于抗病品种根系上附着的分生孢子数量(23个);接种12 hpi,根系上附着的分生孢子开始萌发,但抗/感品种根系表面孢子的萌发率无显著差异;接种3 dpi后,菌丝体能够突破根系表皮,进入细胞间隙,但感病品种根系中菌丝的扩展速度更快,并在7 d后到达根系的维管束内部;而抗病品种则在接种9 dpi,在维管束内才能够观察到绿色荧光信号;接种10 dpi,感病品种根系中可见新的分生孢子梗和分生孢子形成,而抗病品种中未见有分生孢子的形成。接种30 dpi,感病品种地上部茎杆中定殖的病原菌量是抗病品种的5倍以上;同时,感病品种叶柄中的病原菌数量也显著高于抗病品种。
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基于遥感的阿鲁科尔沁旗人工饲草面积及生产经济变化分析
《中国农业资源与区划 》 2023 北大核心 CSCD CSSCI
摘要:[目的]人工饲草的种植规模和生产水平是衡量一个国家畜牧业发达程度的重要标志。及时准确地获取人工饲草种植面积,分析人工饲草生产的长期变化趋势,为饲草产业的发展和管理提供科学的数据支撑。[方法]文章以内蒙古自治区赤峰市阿鲁科尔沁旗为例,基于Google Earth Engine (GEE)云平台和Landsat卫星遥感数据,依据玉米、苜蓿、燕麦3种饲草作物的生长特性和物候差异,使用机器学习算法对2000—2020年3种饲草作物的种植面积进行了逐年提取。在此基础上,结合入户调查数据,分析了3种人工饲草的种植面积、产量、价格在2015—2020年的变化趋势。[结果] 2000—2020年3种饲草作物的种植面积均显著增加,增加的区域位于研究区西部、南部的退化草地和沙地,以及河谷等水资源丰富的区域。在3种人工饲草中,苜蓿种植发展最为迅速,在2010年后种植面积和产量均快速增长;燕麦的种植起步较晚并且种植面积最小;青贮玉米的产量虽然在稳步增加,但是青贮玉米种植面积占全旗玉米总种植面积的比例并没有增加。[结论]阿鲁科尔沁旗人工饲草的种植在2010年开始快速发展,在2015年形成规模化种植,进入平稳发展阶段。人工饲草的种植能够改良退化草地和沙地,但是受水资源分布的影响。苜蓿和燕麦的产量增长是因为种植面积的扩大,青贮玉米产量的增长是因为单产的增长。人工饲草的种植虽然快速增加,但是饲草缺口仍然不能得到满足。
关键词: 人工饲草 作物识别 生产变化 Google Earth engine TM影像
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自发热好氧堆肥养分变化特征研究
《安徽农业科学 》 2023
摘要:[目的]研究羊粪自发热好氧堆肥中不同腐熟阶段的养分变化特征.[方法]通过堆肥的升温期(初始羊粪)、高温期、降温期和腐熟期为研究对象,探讨羊粪自发热好养堆肥4个不同腐熟阶段的温度、含水率、碳氮比(C/N)、有机质、全氮、全磷、全钾、速效磷、速效钾、pH、电导率的变化特征.[结果]羊粪自发热好氧堆肥时长43 d,升温期6 d,55℃以上高温期18 d,降温期13 d,腐熟期6 d.随着堆肥的进程有机质分解,堆体的碳氮比(C/N)逐渐减少;碳氮比总降幅40.69%,升温期和降温期占比70.15%,腐熟期碳氮比19.49可以认为基本腐熟;有机质含量从80.45%减少到60.14%,降温时有机质含量下降速率最快为18.57%,腐熟期最慢为3.76%.全氮、全磷、全钾、速效磷、速效钾、pH随着堆肥的进程呈显著递增,其中降温期速效养分占全磷、全钾百分比最高.电导率随着堆肥的进程先降低后升高,电导率从大到小为腐熟期有机肥>降温期有机肥>未腐熟羊粪>高温期有机肥.[结论]自发热好氧堆肥能够使有机物进行生物降解和生物合成,趋于稳定;通过自发热好氧堆肥了解不同腐熟阶段的有机肥养分特征,旨在为不同腐熟阶段有机肥资源高效利用和土壤培肥提供基础参数.
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内蒙古兴安盟科右前旗农牧业产业发展现状与思考
《当代畜禽养殖业 》 2023
摘要:内蒙古自治区地域辽阔,东中西部资源禀赋受地形、气候及土壤等自然条件差异影响较大,对农牧业产业发展具有不同程度的影响.本文以内蒙古兴安盟科尔沁右翼前旗(简称科右前旗)农牧业产业发展为研究对象,基于自然资源和社会资源禀赋,阐述其农牧业产业发展现状,并立足建设国家农畜产品生产加工基地提出对策建议.
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外源褪黑素诱导下Hippo信号通路调控山羊绒生长mRNA和lncRNA的生物信息学分析
《中国农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为分析绒山羊皮肤中受Hippo信号通路调控的绒生长候选基因集,本研究选取6只罕山白绒山羊随机分为对照组和褪黑素处理组,每组设3个重复。以自然年为试验周期,每月采集皮肤样本进行RNA测序,使用Bowtie、TopHat、Cufflinks、Cuffmerge、Cuffdiff、Cuffcompare、CPAT和CPC软件分析DE-mRNA和DE-lncRNA,联合PCA分析它们对次级毛囊生长周期的应答,利用WGCNA挖掘调控山羊绒生长的基因模块,GSEA分析候选基因集的生物学功能。结果表明:1)筛选得到组间DE-mRNA 2 024个和DE-lncRNA 329个,它们应答了绒山羊皮肤次级毛囊的生长周期。2)获得有生物学意义的对照组7个和试验组9个基因模块。3)深入分析富集到平衡哺乳动物皮肤生长分化、毛囊形态发生的Hippo信号通路基因模块,揭示了外源褪黑素诱导下调控山羊绒生长候选基因集191个mRNA和49个lncRNA的共表达调控网络关系。4)发现候选基因集与皮肤发育生物学过程(|NES|>1且FDR<25%)、Hippo信号通路(|NES|>1且FDR<25%)、Wnt信号通路(|NES|>1且FDR<25%)和细胞周期(|NES|>1且FDR<25%)显著关联。综上,确定了调控山羊绒生长的关键通路Hippo信号通路,在组学水平从基因集角度解析了调控山羊绒生长的mRNA和lncRNA的共表达调控关系,为进一步研究外源褪黑素促山羊绒生长的机制提供参考。
关键词: 绒山羊皮肤 褪黑素 RNA测序 Hippo信号通路 候选基因集
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燕麦种质资源抗倒伏及生物学性状的差异评价
《麦类作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:为了筛选燕麦抗倒伏种质资源,对111份国内外燕麦种质材料的12个性状及倒伏指数进行多样性分析,并对其表现进行综合评价。结果表明,参试材料具有丰富的多样性,遗传多样性指数平均为1.99,各性状的变异系数由高到低依次为主穗粒重(49.22%)、主穗粒数(41.76%)、纤维素含量(36.67%)、抗折力(35.28%)、抗刺穿力(26.06%)、主穗小穗数(25.98%)、茎基部第二节间壁厚(25.79%)、百粒重(24.92%)、茎基部第二节间长(22.86%)、主穗长(19.65%)、茎基部第二节间茎粗(16.06%)、株高(13.69%);倒伏指数与株高、茎基部第二节间长均呈极显著正相关,与抗折力、抗刺穿力均呈极显著负相关。通过通径分析,株高对燕麦倒伏指数影响最大。经主成分分析,前5个主成分对变异的累计贡献率达81.724%,其中前三个主成分分别为主穗因子、茎秆机械强度因子和株高因子。通过聚类分析将供试种质划分为4类,其中第I类种质群抗倒伏能力较强,可作为抗倒伏燕麦育种的亲本。
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内蒙古阿尔山地区全沟硬蜱新塔拉塞维奇立克次体及北极内罗病毒复合感染情况调查
《现代预防医学 》 2023 北大核心
摘要:目的 了解内蒙古阿尔山地区全沟硬蜱(Ixodes persulcatus)携带蜱媒病原体的群落组成及新塔拉塞维奇立克次体(Candidatus Rickettsia tarasevichiae,CRT)和北极内罗病毒(Beiji nairovirus,BJNV)的复合感染情况.方法 在阿尔山市白狼镇采集游离蜱,进行形态学和分子生物学鉴定,对含有未知病原体的蜱类样本提取总RNA后进行宏转录组高通量测序(metagenomic next generation sequencing,mNGS).根据测序结果选取病毒及细菌属水平丰度较高的新发致病病原体进行感染及复合感染情况调查.通过逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法检测蜱体内CRT和BJNV的感染情况.对序列测序结果进行同源性和系统进化关系分析.结果 本研究共采集蜱虫617只,均为全沟硬蜱.高通量测序结果显示细菌组成在属水平上,立克次氏体属(Rickettsia)丰度最高,约为77%;在种水平上,加拿大立克次体(Rickettsia canadensis)丰度最高,约为25%,CRT丰度为约1%.病毒组成在属水平上,正内罗病毒属(Orthonairovirus)丰度最高,约为60%;在种水平上BJNV丰度最高,约为45%.在样本中检测出CRT和BJNV感染,池阳性率(pool positivity rate,PPR)分别为96.15%和88.46%,且存在复合感染现象,最低复合感染率(minimum infection rate,MIR)为3.72%.结论 本研究通过宏转录组揭示了阿尔山地区游离的全沟硬蜱微生物群落中活跃物种的组成,首次证实该地全沟硬蜱中存在CRT以及BJNV复合感染现象.因此,应评估在该地区CRT和BJNV对公共卫生的潜在风险,并加强新塔拉塞维奇立克次体病和BJNV引发疾病的疫情监测.
关键词: 全沟硬蜱 新塔拉塞维奇立克次体 北极内罗病毒 复合感染 宏转录组
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基于GWAS分析的马铃薯主茎数和单株结薯数候选基因挖掘研究
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2023 北大核心 CSCD
摘要:[目的]筛选与马铃薯主茎数和单株结薯数显著关联的单核苷酸多态性(SNP)位点并挖掘候选基因,为高产马铃薯分子育种提供基因资源.[方法]以 251 份马铃薯核心种质为材料,于 2018-2019 年在马铃薯主产区 4个试验点共 8 个环境下对其主茎数和单株结薯数进行表型鉴定;提取 251 份马铃薯种质的 DNA,并采用高通量 Illu-minaHiSeqTM 对DNA进行测序及处理,获得高质量 SNP 标记,在此基础上,结合表型性状进行全基因组关联(GWAS)分析,对显著关联的 SNP位点所在区域的候选基因通过 NR、Swiss-port、KEGG、GO 等 4 个数据库进行功能注释.[结果]2018-2019 年的检测结果表明,在环境和基因型互作下,251 份马铃薯种质间主茎数与单株结薯数有广泛的表型变异.共获得 1 209 969 个高质量 SNP位点,其中与主茎数显著关联的 SNP位点有 7 个,共挖掘到 19 个候选基因,其中在 3 个以上环境重叠的候选基因有 9 个,其可能编码半乳糖醛酸转移酶、转录因子 MYB、赤霉素 3-β-双加氧酶及细胞色素P450;与单株结薯数显著关联的SNP位点有 13 个,共挖掘到 33 个候选基因,去掉 2 年间重叠的4 个候选基因,实际共关联到 29 个候选基因,其中在 3 个以上环境下重叠的候选基因有 11 个,其可能编码果糖-1,6-二磷酸醛缩酶、生长素响应因子 IAA13、转录因子 WRKY、b HLH113 及 MADS-box.[结论]在 2 年 8 个环境下共鉴定出 20 个与马铃薯主茎数和单株结薯数显著相关的 SNP位点,挖掘到 48 个候选基因.
关键词: 马铃薯育种 主茎数 单株结薯数 全基因组关联分析 候选基因挖掘
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