科研产出
橡胶树胶乳均一化全长cDNA文库的构建与EST测序分析
《中国农业科学 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：【目的】构建橡胶树胶乳均一化全长cDNA文库,降低胶乳中存在的高丰度表达基因的拷贝数,提高胶乳表达基因的分离鉴定和EST测序分析效率。【方法】以橡胶树无性系热研7-33-97的胶乳为材料,将胶乳全长cDNA与Gateway供体载体pDONR222重组,构建了橡胶树胶乳的非剪切型全长cDNA原始文库,经检测原始文库的滴度为6.0×106 cfu/mL,平均插入片段长度大于1.5 kb,重组率约为100%,全长cDNA比例约为76%;利用基因组DNA饱和杂交技术对胶乳原始cDNA文库进行均一化处理,构建橡胶树胶乳的均一化全长cDNA文库。【结果】胶乳均一化全长cDNA文库的总库容量(总CFU)为1.87×105,重组率大于95%。定量RT-PCR检测表明,橡胶树胶乳2个高丰度表达基因,即小橡胶粒子蛋白(SRPP)和橡胶延长因子(REF)基因,在均一化cDNA文库中的表达量均下降了约1 000倍。【结论】构建了均一化效果良好的橡胶树胶乳全长cDNA文库,并对文库中随机的12 000个克隆进行了测序,获得高质量的有效EST(expressed sequence tag)序列为11 951条,经拼接共获得单一基因(unigene)为3 394个,其中包括片段重叠群(contig)2 061个和单一EST序列(singlet)1 333个。此cDNA文库将可用于橡胶树功能基因组研究、新基因筛选、高通量EST测序以及橡胶树胶乳cDNA芯片的制备。
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蔬菜产地酸性土壤中Pb、Cd、Cr形态分析研究
《热带作物学报 》 2011 CSCD
摘要：在海南岛中部市县采集了8种蔬菜及其产地酸性土壤样品,采用连续浸提法分析土壤样品中Pb、Cd、Cr元素的水溶态、离子交换态、碳酸盐结合态、铁锰氧化物结合态、有机结合态、残渣态以及全量态等的含量,同时测定了对应蔬菜样本中Pb、Cd、Cr的含量,探讨酸性土壤Pb、Cd、Cr元素的形态分析方法、分布规律及对蔬菜含量的影响。结果表明:Pb、Cd、Cr元素形态分析结果的符合率分别为107%、94%和81%。3元素各形态含量占全量的百分比大小顺序分别为:Pb元素的残渣态>铁锰氧化物结合态>有机物结合态>碳酸盐结合态>离子交换态>水溶态;Cd元素的碳酸盐结合态>残渣态>离子交换态>水溶态>有机物结合态>铁锰氧化物结合态;Cr元素的残渣态>有机物结合态>水溶态>铁锰氧化物结合态>离子交换态>碳酸盐结合态。土壤中有70%以上的Pb、Cr离子处于被固定的状态(即残渣态),不容易被植物吸收,而有70%以上的Cd离子处于活化状态,容易被植物吸收,说明Cd元素是蔬菜无公害安全质量生产中重要的风险控制指标。
关键词： 酸性土壤 蔬菜 Pb、Cd、Cr形态分析
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CETP基因1405V多态性与海南百岁人群长寿的相关性
《中国老年学杂志 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：目的 了解海南人群CETP基因I405V突变位点多态性与长寿的相关性.方法 收集海南省276例百岁老人及301例健康对照人群全血DNA,利用AS-PCR的方法检测CETP基因I405V突变位点的多态性,并利用SPSS13.0对检测结果进行统计学分析.结果 I405V基因型及等位基因频率分布在两组间存在显著差异(χ<'2>=31.954,P<0.001;χ<'2>=29.395,P<0.001).结论 CETP基因I405V突变位点多态性与海南长寿有着显著关联,等位基因I可能与长寿密切相关,而突变型等位基因V可能对机体的衰老有促进作用.
关键词： 长寿 百岁老人 CETP基因多态性 I405V 突变位点
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几个橡胶树胶木兼优品系寒害后生长及产量研究初报
《热带作物学报 》 2011 CSCD
摘要：比较分析中国热带农业科学院橡胶树胶木兼优中心试验区7个参试品系2008年寒害后2 a内的生长及产量情况。结果表明:寒害后在茎围年均增粗上,品系间存在显著差异,热试8和热试10生长速度较快,热试10在寒害后仍保持较快的增粗幅度;在年株产干胶上,各品系间存在显著差异。热试8及热试13显著优于对照,且2 a内的增产幅度较大,热试10与对照相当。综合分析,热试8及热试10在生长量及产量上均表现较优,符合胶木兼优选育要求,而且本次寒害适应性表现较好,建议根据品种特性在相同类型植胶区扩大试种试验。
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解磷菌株黑曲霉PSFM发酵条件优化研究
《南方农业学报 》 2011 CSCD
摘要：【目的】利用液体培养法探究不同碳源、氮源、无机盐和微量元素浓度以及发酵时间、温度、初始pH、转速、接种量等条件对解磷菌解磷特性的影响,获得解磷菌的最佳发酵培养基和培养条件。【方法】采用单因素及正交试验法,对一株分离自土壤的解磷真菌黑曲霉(Aspergillus niger)PSFM菌株的基础发酵培养基和发酵条件(发酵时间0～10d、温度20～40℃、初始pH值3.0～11.0、接种量1%～11%、转速120～300rpm)进行优化,测定其发酵液吸光度值,以解磷量的高低作为评价发酵培养基及发酵条件优劣的指标。【结果】分别在无机磷和有机磷液体培养基、简单培养基(SP)、NBRIY、NBRIP、NBRIYP培养基中培养6d后,以无机磷液体培养基的PSFM菌株解磷能力最高,解磷量为526.42mg/L。在12种不同碳源培养基中,PSFM均能正常生长,其解磷能力由大到小依次为:木糖>葡萄糖>乳糖>蔗糖>麦芽糖>半乳糖>山梨糖>甘露糖>果糖>可溶性淀粉>鼠李糖>甘油。以硝酸钠、尿素、酵母浸膏、氯化铵、硝酸镁、硝酸铵、色氨酸、乙酸铵、牛肉浸膏、胰-蛋白胨、甘氨酸、酪氨酸、丙氨酸和精氨酸为氮源时,硫酸铵为唯一氮源的解磷效果最好,菌株PSFM发酵液中有效磷含量最高(990.31mg/L)。菌株PSFM的解磷能力均随着最佳培养基中NaCl、KCl、MgSO4·7H2O、FeSO4·7H2O和MnSO4·7H2O浓度的增加呈先提高后降低趋势,当其浓度分别为0.03%、0.01%、0.03%、0.001%、0.001%时,菌株PSFM的解磷能力均最强。在不同发酵条件下,以发酵6d、温度28℃、初始pH6.0、5%接种量、转速300rpm的PSFM解磷能力最强,解磷量分别为599.24、528.23、603.69、530.57和731.48mg/L。【结论】最适合PSFM菌株的基础发酵培养基为无机磷液体培养基,碳源为1.0%木糖,氮源为0.10%硫酸铵,最佳无机盐配方为:NaCl0.10g/L、KCl0.70g/L、MgSO·47H2O 0.70g/L、FeSO4·7H2O 0.01g/L、MnSO·47H2O 0.01g/L;最佳培养条件为:温度28℃,初始pH6.0,转速180rpm,接种量5%,发酵时间为6d。
关键词： 解磷菌 黑曲霉 发酵培养基 发酵条件 优化 正交试验
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香蕉MaROP1基因表达产物的亚细胞定位
《基因组学与应用生物学 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：植物类Rho相关G蛋白(Rho-related GTPases from plants,ROP)属于小G蛋白超家族,是高等植物体内广泛存在的一类重要信号分子,在植物生长发育过程中起着关键的调控作用。本实验室从香蕉果实采后抑制差减杂交文库中获得一个香蕉ROP基因,命名为MaROP1。半定量RT-PCR表明该基因在香蕉的根、球茎、叶、花和果实中的表达存在差异,其中在球茎中的表达量最高且与其它器官的表达差异显著。为进一步研究该基因的功能,构建了以绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)为报告基因的融合植物表达载体pCAMBIA1302-MaROP1,并利用基因枪转化法将重组载体转入洋葱表皮细胞瞬时表达,荧光显微镜检测表明该基因表达产物定位在细胞膜上。
关键词： 香蕉(Musaspp.) MaROP1 表达分析 植物表达载体 亚细胞定位
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橡胶树尖孢炭疽菌分子检测及遗传多态性分析
《热带作物学报 》 2011 CSCD
摘要：根据GeneBank中Colletotrichum属的20个种的ITS序列,比较设计出1对引物CAF53/CAR356(CAF53 5'-GGG CAG GGG AAG CCT CTC G-3';CAR356 5'-AGC GGT GCT TGA GGG TTG-3');该引物可以扩增出1条303 bp的尖孢炭疽菌特异性DNA条带。并利用ISSR和RAPD分子标记技术对从海南、广东、广西和云南等垦区橡胶树上收集的21个尖孢炭疽菌株进行遗传多态性分析,以杧果上分离的尖孢作为参照菌株进行了聚类分析。结果表明,RAPD的平均遗传相似系数为0.8,ISSR的平均遗传相似系数为0.7,2种分子标记的平均遗传相似系数基本一致,均可揭示尖孢炭疽病菌的遗传多态性;2种分子标记产生的聚类分析结果存在一定差异;ISSR和RAPD类群与菌株的地理来源均不存在相关性。
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3个品种香蕉果实中糖酸组分及含量的比较分析
《热带作物学报 》 2011 CSCD
摘要：用高效液相色谱(HPLC)法测定皇帝蕉(贡蕉)、巴西蕉和粉蕉成熟果实中糖酸组分及含量。结果表明,成熟果实中均含有蔗糖、葡萄糖和果糖,并以积累蔗糖为主,皇帝蕉(贡蕉)、巴西蕉和粉蕉果实中蔗糖含量分别占总糖的59.76%、66.18%、68.69%,总糖含量大小表现为,皇帝蕉>巴西蕉>粉蕉;均含有11种有机酸,以苹果酸为主,含量分别占总酸的51.71%、47.30%、46.68%,同时含有大量的柠檬酸,分别占总酸的18.13%、19.62%和19.96%,并富含多种有机酸,总酸含量大小是粉蕉>巴西蕉>皇帝蕉。
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