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橡胶树尖孢炭疽菌分子检测及遗传多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘先宝 1 ; 林春花 1 ; 蔡吉苗 1 ; 蔡志英 1 ; 李超萍 1 ; 黄贵修 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室

关键词： 橡胶树;尖孢炭疽;分子检测;遗传多态性

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2011 年 32 卷 02 期

页码： 88-92

收录情况： CSCD

摘要： 根据GeneBank中Colletotrichum属的20个种的ITS序列,比较设计出1对引物CAF53/CAR356(CAF53 5'-GGG CAG GGG AAG CCT CTC G-3';CAR356 5'-AGC GGT GCT TGA GGG TTG-3');该引物可以扩增出1条303 bp的尖孢炭疽菌特异性DNA条带。并利用ISSR和RAPD分子标记技术对从海南、广东、广西和云南等垦区橡胶树上收集的21个尖孢炭疽菌株进行遗传多态性分析,以杧果上分离的尖孢作为参照菌株进行了聚类分析。结果表明,RAPD的平均遗传相似系数为0.8,ISSR的平均遗传相似系数为0.7,2种分子标记的平均遗传相似系数基本一致,均可揭示尖孢炭疽病菌的遗传多态性;2种分子标记产生的聚类分析结果存在一定差异;ISSR和RAPD类群与菌株的地理来源均不存在相关性。

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