香蕉查尔酮合酶基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡会刚

作者： 胡会刚;胡玉林;庞振才;陈晶晶;段雅婕;李伟明;孙德权

作者机构：

关键词： 香蕉;查尔酮基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 21 期

页码： 6931-6937

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成的关键酶,在类黄酮的合成过程中起重要的作用。为了探索CHS基因家族在调控黄酮类物质合成的功能,本研究对20个香蕉CHS基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:1个香蕉CHS基因没有内含子,大多含有2～3个内含子;20个香蕉CHS蛋白中有6个偏碱性,6个显中性,8个偏酸性;除2个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉CHS蛋白主要以α-螺旋为主要构成元件;稳定指数分析发现4个CHS蛋白为稳定蛋白;脂溶指数分析表明1个香蕉CHS蛋白为疏水性蛋白;亚细胞定位分析表明大多数CHS蛋白定位于细胞基质,一个分布于细胞核;基序1、基序2、基序3是该家族的保守基序。

分类号： Q943.2`S668.1

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