近20年中国部分地区鸡源H9N2亚型禽流感病毒HA基因遗传演化及其变异频率

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟芳

作者： 孟芳;徐怀英;张伟;黄迪海;张再辉;刘霞;常维山;秦卓明

作者机构：

关键词： H9N2;禽流感;HA基因;进化;变异频率

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2016 年 56 卷 01 期

页码： 35-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过比较不同时期的H9N2亚型禽流感流行毒株HA基因的分子特征和变异频率,揭示免疫压力下病毒的遗传演化趋势。【方法】选取源于课题组的40株鸡源H9N2毒株,以及从Gen Bank下载的136株中国鸡源H9N2流行毒株和7株经典毒株的序列,利用Lasergen 7.1和MEGA 5.1等软件,对其HA基因进行系统演化、分子特征和变异频率分析。【结果】系统发育分析表明,近20年的鸡源H9N2流行株分属于BJ94、Y280和S2等谱系,优势流行株的分布与年代密切相关。氨基酸序列比较显示,H9N2病毒不同谱系之间具有各自的特征,且存在着明显的氨基酸变异积累。以Ck/BJ/1/1994 HA基因为参照,1994–2014年间,H9N2流行株核苷酸和氨基酸的年均进化率分别为5.73×10~(–3)和4.25×10~(–3)。其中,2011–2014年的核苷酸(氨基酸)年均进化率为6.35×10~(–3)(5.32×10~(–3)),明显高于2006–2010年5.22×10~(–3)(3.70×10~(–3)),更显著高于疫苗推广初期1999–2005年的0.74×10~(–3)(0.50×10~(–3))。【结论】H9N2疫苗株和流行毒株的不匹配是病毒变异频率加快的重要原因。

分类号： S852.65

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