茶树幼根cDNA文库构建及其表达序列标签特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵丽萍

作者： 赵丽萍;马春雷;陈亮

作者机构：

关键词： 茶树;幼根;cDNA文库;表达序列标签;基因表达谱

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2008 年 6 卷 05 期

页码： 77-82

收录情况： CSCD

摘要： 以茶树龙井43实生苗新生幼根为材料,应用pBluescript Ⅱ XR cDNA Library Construction Kit,构建了我国第一个茶树幼根cDNA文库。测试结果表明原始文库的滴度为1.85×107pfu/mL,重组率为85.7%,插入片段绝大多数分布在1.0～1.5kb左右。随机挑选5115个克隆进行序列测定,去除空载体和插入片段短于150bp的序列后,获得有效序列4833个,经过序列拼接后共获得3482条表达序列标签(expressed sequence tags,EST),包括901个contigs和2581个singletons。通过与NCBI等非冗余蛋白质数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能基因或具推测功能的EST共1376个,代表943个茶树功能基因,421个EST为未知功能基因,1685个EST为新的表达基因。这些数据将为将为我们从分子水平上更好地了解、研究、调控茶树的生理代谢、生长发育和品质等提供极有价值的资源。

分类号： S571.1

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