去势和非去势公猪背最长肌circRNA差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邢宝松

作者： 邢宝松;王璟;陈俊峰;马强;任巧玲;张家庆;张华;滑留帅;孙加节;曹海

作者机构： 河南省农业科学院畜牧兽医研究所;华南农业大学动物科学学院;河南兴锐农牧科技有限公司

关键词： 环状RNA;去势;公猪;背最长肌

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2021 年 43 卷 011 期

页码： 1066-1077

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 公猪去势可减少异味和打斗,但去势后产肉量和肌内脂肪沉积发生变化,其分子机制的解析对生产具有重要意义.近年来研究表明,环状RNA(circRNA)在肌肉发育中具有重要调控作用.为探究去势后circRNAs对背最长肌发育的调控,本研究选择6头淮南公猪,随机选择3头去势,当体重达130 kg左右屠宰,采集背最长肌样品,利用高通量测序筛选差异表达circRNAs(differentially expressed circRNAs,DECs)并进行KEGG功能富集分析.结合前期筛选的公猪去势相关miRNAs,构建DECs-miRNAs调控网络,最后使用猪骨骼肌卫星细胞验证候选circRNA表达谱及其与miRNA互作关系.结果表明,去势和非去势组背最长肌样品共获得5866个circRNAs,两组之间共有370个DECs(|log2Foldchange|>1,padj<0.8),KEGG富集分析表明,DECs来源母基因主要富集于肌肉发育、肌纤维类型转化、能量代谢等相关通路.构建的DECs-miRNA调控网络共包括69个circRNAs和8个miRNAs.选择circRNA_2241和circRNA_4237进行验证,结果发现这两个circRNAs真实存在且表达趋势与测序结果一致.进一步在猪骨骼肌卫星细胞初步验证circRNA_2241与miR-1互作关系,结果表明睾酮显著促进circRNA_2241表达,同时抑制miR-1表达.本研究结果提示circRNAs可能通过与miRNAs互作调控猪去势后背最长肌发育,从而为解析去势对肌肉发育调控的分子机制提供参考.

分类号： S828

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