基于重测序数据的猪繁殖性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吕玲燕

作者： 吕玲燕;林昌华;张胜斌;覃秀珍;柏秀芳;吴永绍;陈钊;刘磊;孙如玉;张冰;张家庆

作者机构：

关键词： 重测序;猪;繁殖性状;全基因组关联分析

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2025 年 61 卷 001 期

页码： 235-241

收录情况： 北大核心

摘要： 为从全基因组水平上探究影响母猪繁殖性状的分子机理，本试验对连续3胎不同产仔数的母猪进行全基因组重测序及关联分析，挖掘参与调控母猪高低产仔数性状的关键调控基因。本试验选取高繁母猪21头，低繁母猪19头，采用illumina novaseq 6000 PE150平台对40个文库进行全基因组重测序，结合母猪连续3胎产仔数的表型性状，基于GLM混合线性模型，并利用质控后的14 708 672个SNP标记进行全基因组关联分析。结果表明：总产仔数性状有87个SNP达基因组水平显著，候选基因包括RORA、SFRP1、HSD17B1、IGF1；产活仔数性状有73个SNP达基因组水平显著，候选基因包括DAZL、STAT3；健仔数性状有66个SNP呈基因组水平显著，候选基因包括DAZL、HSD17B1、STAT3；根据基因功能注释推测IGF1、DAZL、HSD17B1、SFRP1、STAT3是繁殖性状的重要候选基因。本研究为猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。

分类号： S828.2

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