水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宋兴超
作者: 宋兴超;刘琳玲;王淑明;宋姗姗;徐超;杨童奥;刘宗岳;丛波;张志明;杨福合;彭英华
作者机构:
关键词: 水貂;ASIP基因;单倍型;差异表达;被毛颜色
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2019 年 010 期
页码: 2998-3006
收录情况: 北大核心
摘要: 试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响.通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性.结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型.5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态.实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P>0.05).研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异.
分类号: S865.22
- 相关文献
[1]水貂酪氨酸酶(TYR)基因克隆、SNPs筛查及其皮肤组织mRNA差异表达分析. 宋兴超,刘琳玲,潘虹军,赵家平,贾赟,杨福合,徐超. 2021
[2]中国绵羊ASIP基因突变研究. 付冬丽,杨广礼,郎侠,成述儒,王玉涛,方素栎,罗玉柱. 2014
[3]阿勒泰羊与新疆细毛羊ASIP基因多态性与被毛颜色的相关性. 孟浩浩,许瑞霞,石国庆,马春萍,张永胜,周月娥,万鹏程,代蓉. 2014
[4]不同被毛颜色成年斯布牦牛生长性能比较及分子育种潜力分析. 朱勇,阮鹏程,俄广鑫,信金伟,张强,陈晓英,曹涵文,姜辉,鲜莉莉,陆东祥,张成福. 2024
[5]畜禽羽色候选基因ASIP和TYRP1的研究进展. 张静,刘毅,刘安芳. 2015
[6]不同毛色羊驼毛品质的差异研究. 张敏,郑文新,王乐,宫平,陈华峰,胡昕,库木斯·哈布多拉,阿依古丽·玉苏甫,高扬,采复拉·大木拉,段新华. 2021
[7]赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析. 吴建明,李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010
[8]斑点叉尾(鮰)血浆铜蓝蛋白的全长cDNA克隆及表达特征分析. 孟艳青,党广成,刘洋,王启龙,沙珍霞. 2013
[9]芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析. 刘影,徐文静,杜茜,杨信东,李启云. 2010
[10]高羊茅春化基因FaVRN1亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,舒健虹,王舒颖. 2011
[11]cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物基因差异表达上的应用及其分析比较. 李杨瑞,杨柳,王爱勤,杨丽涛,熊发前,甘崇昆. 2009
[12]青海高原耐旱蚕豆品种青海13号响应干旱胁迫蛋白质组学分析. 李萍,侯万伟,刘玉皎. 2019
[13]高羊茅光周期调控基因FaCONSTANS亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,王舒颖,舒健虹. 2011
[14]骨形态发生蛋白IB型受体(BMPR-IB)基因在蒙古羊卵巢和子宫组织中的表达分析. 何小龙,刘永斌,王峰,田春英,达赖,荣威恒. 2010
[15]甘蔗cDNA-SCoT差异显示分析PCR反应体系建立、优化及应用. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明. 2013
[16]水稻分蘖期强势和弱势F_1基因表达差异分析. 戴正元,陈建民,肖宁,周长海. 2010
[17]6个wnt基因家族基因在细粒棘球绦虫原头节和成虫的差异表达分析. 王正荣,张艳艳,薄新文,徐雪平,徐春生. 2016
[18]奶牛初乳与常乳乳蛋白变化的比较蛋白质组学研究. 杨永新,王加启,卜登攀,张乐颖,李珊珊,张春林,周凌云. 2010
[19]鸭IGF-IR基因部分序列克隆、鉴定及在胚胎期胸肌组织中的差异表达分析. 束婧婷,单艳菊,胡艳,宋迟,宋卫涛,朱文奇,徐文娟,陈文峰,李慧芳. 2013
[20]高邮鸭和金定鸭发育早期骨骼肌发育及胰岛素样生长因子1受体基因(IGF-IR)表达分析. 朱春红,徐文娟,胡艳,朱文奇,宋迟,陈文峰,李慧芳. 2013
作者其他论文 更多>>
-
毛皮动物性情的判定及其影响因素研究进展
作者:石宏宇;周建颖;张海华;刘宗岳
关键词:毛皮动物;性情;动物福利;性情判定
-
鹿源藿香假丝酵母菌DZ018的分离鉴定及其体外益生特性研究
作者:黄姚;么乃全;袁伟涛;毛爱鹏;张婷;徐超
关键词:藿香假丝酵母菌;梅花鹿;分离鉴定;益生特性
-
小麦籽粒DON积累动态及其影响因素相关性分析
作者:陈宏州;张海波;周晨;朱友理;杨红福;徐超;郭晓萌;朱凤
关键词:小麦赤霉病;脱氧雪腐镰刀菌烯醇;积累动态;病情指数;赤霉病粒
-
E3 泛素连接酶MARCH1 抗病毒感染研究进展
作者:于长清;彭永刚;张贺;李明翔;徐超;张斌;先元华;汤艳东
关键词:MARCH1;天然免疫;抗病毒;囊膜糖蛋白;弗林蛋白酶
-
水貂健康养殖与动物福利研究进展
作者:刘宗岳;李虎;邵西群;李想;张海华;任二军;王宝东;张铁涛
关键词:水貂;健康养殖;动物福利
-
不同环剥处理对'金艳'猕猴桃光合特性及果实品质的影响
作者:王斯妤;杨思潮;陈钱;涂贵庆;张萌;徐超;陈东元;金玲莉
关键词:猕猴桃;环剥;光合特性;产量;果实品质
-
蜡样芽孢杆菌挥发物对苹果轮纹病菌的拮抗活性
作者:覃艮红;袁洪波;王卓妮;史冰柯;范洋洋;王丽;张猛;涂洪涛;徐超;侯珲
关键词:芽孢杆菌;苹果轮纹病;挥发性有机化合物;苯甲醛;生物防治
