水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 宋兴超

作者: 宋兴超;刘琳玲;王淑明;宋姗姗;徐超;杨童奥;刘宗岳;丛波;张志明;杨福合;彭英华

作者机构:

关键词: 水貂;ASIP基因;单倍型;差异表达;被毛颜色

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2019 年 010 期

页码: 2998-3006

收录情况: 北大核心

摘要: 试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响.通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性.结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型.5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态.实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P>0.05).研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异.

分类号: S865.22

  • 相关文献

[1]水貂酪氨酸酶(TYR)基因克隆、SNPs筛查及其皮肤组织mRNA差异表达分析. 宋兴超,刘琳玲,潘虹军,赵家平,贾赟,杨福合,徐超. 2021

[2]中国绵羊ASIP基因突变研究. 付冬丽,杨广礼,郎侠,成述儒,王玉涛,方素栎,罗玉柱. 2014

[3]阿勒泰羊与新疆细毛羊ASIP基因多态性与被毛颜色的相关性. 孟浩浩,许瑞霞,石国庆,马春萍,张永胜,周月娥,万鹏程,代蓉. 2014

[4]不同被毛颜色成年斯布牦牛生长性能比较及分子育种潜力分析. 朱勇,阮鹏程,俄广鑫,信金伟,张强,陈晓英,曹涵文,姜辉,鲜莉莉,陆东祥,张成福. 2024

[5]畜禽羽色候选基因ASIP和TYRP1的研究进展. 张静,刘毅,刘安芳. 2015

[6]不同毛色羊驼毛品质的差异研究. 张敏,郑文新,王乐,宫平,陈华峰,胡昕,库木斯·哈布多拉,阿依古丽·玉苏甫,高扬,采复拉·大木拉,段新华. 2021

[7]木薯干旱胁迫响应基因MeGSTU7自然变异分析. 王斌,曾长英,郭鑫,彭明. 2015

[8]根据EH277045衍生序列变异分析中国互花米草种群的遗传结构. 吴娟子,王强,陈建群. 2011

[9]贵州瑶山鸡线粒体DNA D-loop区序列的多态性. 韩雪,吴松成,朱丽莉,陶宇航. 2015

[10]亚洲玉米螟化性遗传规律研究. 黄艳玲,袁海滨,李启云,高月波,张正坤,王振营. 2015

[11]优质鸡MEF2A基因的SNPs检测及其与屠体性状的相关研究. 周艳,刘益平,蒋小松,杜华锐,朱庆. 2009

[12]新疆锡伯族人群线粒体DNA的遗传学分析. 于长春,李文荣,谢力,张小雷,周慧,朱泓. 2007

[13]长牡蛎酪氨酸酶基因(CgTyr1)SNP多态性与壳色性状的关联. 赵博文,李琪,王九龙,于红. 2020

[14]CYP2C19基因与药物代谢相关性研究进展. 杜红丽,王靖方,崔建勋,凌飞,魏冬青,王小宁. 2008

[15]我国根瘤蚜mtDNA CO Ⅰ遗传多样性与系统发育(英文). 陈迎春,王海波,D.A. DOWNIE,翟衡. 2009

[16]泛希姬蝽不同地理种群的遗传多样性和遗传分化. 田小娟,唐艺婷,刘晨曦,张礼生,陈红印,王孟卿. 2019

[17]绵羊Y染色体基因鉴定及其与父系起源的研究进展. 谢云龙,秦芳,李万宏,李发弟,乐祥鹏. 2017

[18]利用DNA池和测序技术快速筛查候选效应单倍型. 杜红丽,崔建勋,张细权. 2008

[19]基于叶绿体SSR单倍型分析普通杏演化关系. 魏潇,章秋平,刘威生,刘宁,张玉萍,徐铭,刘硕,张玉君,马小雪. 2018

[20]谷子种子线虫检测及分析. 宋振君,李志勇,王永芳,全建章,马继芳,白辉,董志平. 2019

作者其他论文 更多>>