出芽短梗霉菌株PA-2胁迫下藜qRT-PCR内参基因的筛选与验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晓芳

作者： 刘晓芳;程亮;郭青云

作者机构：

关键词： 出芽短梗霉菌株PA-2;qRT-PCR;藜;内参基因;表达稳定性

期刊名称： 中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2024 年 46 卷 002 期

页码： 48-56

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选适合出芽短梗霉菌株PA-2胁迫下藜中稳定表达的内参基因,在转录组数据(NCBI登录号为:SRA:SRR12674257)分析的基础上,以PA-2不同时间胁迫的藜叶片为材料,分析藜中ACT-1、TUB-1、GAPDH、eEF1α、eIF3、UBQ、PTB、COX10、UPL6、TIP41L、RAN-B1 和IDH-5 等 12 个内参基因的表达水平,并利用ΔCt、GeNorm、NormFinder、BestKeeper及RefFinder分析候选内参基因的表达稳定性.结果表明,内参基因COX10是PA-2不同时间胁迫下藜中最稳定的内参基因,最优组合是COX10+eEF1α.通过分析藜ACC基因的相对表达水平,验证了内参基因的可靠性,为今后杂草藜胁迫响应基因的表达分析提供了参考基因和理论依据.

分类号： S451

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