口蹄疫病毒强毒株China/99 P2区核苷酸序列测定及比较分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张显升
作者: 张显升;赵启祖;刘在新;江鹏斐;常惠芸;陈应理;李冬;魏怀录;谢庆阁
作者机构:
关键词: 口蹄疫病毒;China/99;P2基因;序列比较
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2002 年 33 卷 05 期
页码: 496-500
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以口蹄疫病毒强毒株China/99RNA为反转录模板 ,用一对特异性引物扩增目的cDNA ,然后与 pGEM TEasy载体连接并转化JM10 9菌株 ,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定。序列测定和分析结果表明 ,该强毒株与A12、O1K和TW 45毒株的核苷酸差异率分别为 7 78%、6 6 2 %和 13 19%。推导的氨基酸序列差异率分别为 1 2 3%、1 84%和 5 73%。 4个毒株序列比较发现 ,China/99、O1K和TW 45三毒株的 2A/2B连接处为甘氨酸 /脯氨酸 ,A12 为精氨酸 /脯氨酸 ,而且T C转换率和A G转换率较高 ,是点突变的热点核苷酸。氨基酸差异主要存在于 2B和 2C蛋白中 ,2A基因较为保守。 2B蛋白的第 1 4,6 3 6 7,73 78,83 91,116 12 1和 12 6 131区域 ,2A蛋白的第 4 9区域和 2C蛋白的第 9 13,2 2 2 5 ,91 96 ,15 0 15 9,179 188,2 0 1 2 0 7和 2 5 8 2 6 2区域可能是重要的活性中心。
分类号: S852.65
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