虹鳟传染性胰脏坏死性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 欧阳少琪

作者： 欧阳少琪;赵云峰;蒋丽;杨润清

作者机构：

关键词： 虹鳟;胰脏;全基因组关联分析

期刊名称： 山东农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2324

年卷期： 2022 年 53 卷 004 期

页码： 618-623

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究虹鳟传染性胰脏坏死症(Infectious Pancreatic Necrosis,IPN)抗性的遗传基础,本文采用三种二歧性状的分析方法,对来自58个全同胞家族的749尾虹鳟(271尾抗性和478尾易感),注射传染性胰脏坏死病毒后的存活情况进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS).关联分析结果表明,共鉴定到两个QTN与虹鳟IPN抗性显著关联,位于四号染色体和对应的Scaffold上.以这些检测到的QTNs作为探针,对比虹鳟全基因组信息,筛选得到四个候选基因,它们可能是影响虹鳟IPN抗性的重要功能基因.通过对比三种方法的检测结果,得知GRAMMAR-Lambda法对检测二歧性状QTNs的统计能力略高于SAIGE和GMMAT法,具有更好的统计性能.这些研究结果为虹鳟抗传染性胰脏坏死病毒的遗传选育提供了分子标记,为虹鳟抗传染性胰脏坏死病毒的研究提供了理论基础.

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]哲罗鱼肝脏和胰脏发生和发育的组织学研究. 关海红,尹家胜. 2011

[2]中国大鲵小肠和胰脏的超微结构观察. 王尚洪,余扬帆,王芳,吴娣,黄洪辉,吴志强. 2012

[3]用豆油代替鱼油对虹鳟生长、非特异性免疫和组织酶活性的影响. 徐奇友,许红,李婵,杨萍,王常安. 2009

[4]复方中草药对虹鳟抗氧化能力的影响. 孙裔雷,王荻,刘红柏. 2015

[5]4个虹鳟养殖品系的分子鉴定和遗传多样性分析. 徐浩,鲁翠云,郭薇,孙效文. 2013

[6]热应激对虹鳟部分非特异性免疫指标的影响. 王艳妮,刘哲,康玉军,李珍,施海娜,张久盘,王建福,蒋丽,黄进强. 2015

[7]虹鳟完全双列杂交试验生长性状遗传分析. 李艳红,李宁,蒋丽,谷伟,张晓慧,杨润清,王炳谦. 2015

[8]虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、溪红点鲑(Salvelinus fontinalus)及杂交种(虹鳟♀×溪红点鲑♂)血清蛋白多态性的研究. 张立颖,赵萌,李文通,袁丁,杨贵强. 2013

[9]虹鳟肠炎红嘴病病原菌的确定及其生长特性研究. 连浩淼,卢彤岩,刘红柏,尹家胜,张辉,李绍戊. 2015

[10]虹鳟体质量和主要体尺性状异速生长的遗传分析. 詹金绵,王炳谦,谷伟,刘英杰,杨润清. 2015

[11]虹鳟(♀)×溪红点鲑(♂)杂交三倍体F1及其亲本肌肉营养成分的比较. 徐绍刚,杨晓飞,代国庆,杨贵强,李文通. 2014

[12]虹鳟常见病毒性疾病的诊断与防治. 陈春娜,黄颖颖. 2009

[13]用于鉴别大西洋鲑和虹鳟的生物传感检测方法. 赵紫霞,徐桂彩,李炯棠,杨世勇. 2017

[14]Sox9和amh基因在雌、雄虹鳟和伪雄鱼各组织中的表达模式分析. 谷伟,黄天晴,徐革锋,王炳谦. 2019

[15]三倍体雌性虹鳟性腺发育阶段细胞色素相关基因的表达. 相福生,徐革锋,谷伟,黄天晴,刘晨斌,王炳谦. 2018

[16]“微流水+纯氧压力增氧”模式下虹鳟养殖技术. 原辉,郝丽峰,李毅,韩鹏远. 2017

[17]几种鲑鳟鱼血清蛋白非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的研究. 杨贵强,徐绍刚,王建,高云奇,王占全. 2013

[18]虹鳟PPARα基因克隆、序列分析及其组织表达分布. 贾成霞,张照斌,张清靖,刘盼,朱华. 2012

[19]虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、溪红点鲑(Salvelinus fontinalus)及杂交种(虹鳟♀*溪红点鲑♂)血清蛋白多态性的研究. 张立颖,赵萌,李文通,袁丁,杨贵强. 2013

[20]盐度对虹鳟和硬头鳟幼鱼消化酶和抗氧化酶活性的比较研究. 杨静雯,周演根,黄铭,熊莹槐,王芳,高勤峰,孙大江,董双林. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序