Hi-GLMM的应用对提高疾病性状基因组关联分析检测效率的影响
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐亚楠
作者: 徐亚楠;杨理昂;杨润清;李淑玲
作者机构:
关键词: 分层广义线性混合模型;基因组最佳线性无偏预测;基因组估计育种值;二分类性状
期刊名称: 东北农业大学学报
ISSN: 1005-9369
年卷期: 2024 年 55 卷 008 期
页码: 208-221
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为降低计算复杂度,研究提出一种基于广义线性混合模型新型简化算法——分层广义线性混合模型(Hi-GLMM)。采用基因组最佳线性无偏预测方法(GBLUP)对正态基因组变量估计,获得基因组估计育种值(GEBVs),通过广义最小二乘方法在全基因组范围内逐个关联检验每个标记的加性效应。模拟与实际结果表明:Hi-GLMM可有效控制统计错误,提高二分类性状基因检测效率,并成功检测到与多种疾病显著相关的遗传位点。
分类号: Q811.4
- 相关文献
[1]玉米穗轴粗和出籽率全基因组预测分析. 马娟,曹言勇,朱卫红. 2021
[2]基于简化基因组测序技术和基因芯片技术比较研究黄羽肉鸡基因组选择. 刘天飞,罗成龙,王艳,周广源,马杰,舒鼎铭,苏国生,瞿浩. 2020
[3]基因组选择及其在作物育种中的应用. 陈雨,姜淑琴,孙炳蕊,潘大建,范芝兰,陈文丰,李晨. 2017
[4]基因组选择在羊育种中的应用研究进展. 张统雨,魏霞,张勤,杜立新,王立贤,赵福平. 2018
[5]利用全基因组选择培育高繁猪新品系初步研究. 付言峰,任守文,涂枫,王学敏,廖超,俞正玉,程金花. 2023
作者其他论文 更多>>
-
采用期望最大化算法的半滑舌鳎性逆转性状高效遗传解析
作者:宋禹昕;常中宇;高进;赵云峰;杨润清;蒋丽
关键词:全基因组关联分析;半滑舌鳎;性逆转;主成分;期望最大化算法;广义线性模型
-
淹水胁迫下水稻种子和胚芽葡萄糖供应差异与胚芽存活的关系
作者:郑广杰;叶昌;朱均林;陶怡;肖德顺;徐亚楠;褚光;徐春梅;王丹英
关键词:淹水逆境;水稻种子;胚芽存活率;葡萄糖;α-淀粉酶;抗氧化酶
-
寒地粳稻在长江下游地区作双季早粳稻产量和品质表现分析
作者:徐亚楠;陶怡;叶淑珍;徐春梅;陈松;褚光;王丹英;欧阳由男
关键词:双季早粳稻;积温带;有效穗数;品质;产量
-
水稻叶片衰老转色与氮循环利用及挥发关系的研究进展
作者:陶怡;徐亚楠;叶昌;郑广杰;徐春梅;陈松;褚光;刘元辉;王丹英
关键词:水稻;N再利用;N挥发;叶绿素
-
叶面喷施磷糖类制剂对冬小麦抗干热风影响的作用
作者:徐亚楠;韩燕;吴玥;宋吉青;柳斌辉;韩伟;白文波
关键词:干热风;冬小麦;化学制剂;叶片荧光;灌浆动态;产量
-
水稻种子萌发出苗研究及直播生产上相关难题
作者:郑广杰;陶怡;沈兴连;叶昌;徐亚楠;褚光;徐春梅;王丹英
关键词:水稻;种子萌发;出苗;直播全苗
-
虹鳟传染性胰脏坏死性状全基因组关联分析
作者:欧阳少琪;赵云峰;蒋丽;杨润清
关键词:虹鳟;胰脏;全基因组关联分析