许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道微生物群结构特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜燕

作者： 姜燕;曹亚男;柳学周;徐永江;李德军;史宝;王滨

作者机构：

关键词： 许氏平鲉;仔鱼;稚鱼;幼鱼;肠道微生物群;核心菌群

期刊名称： 水产科学

ISSN： 1003-1111

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 200-208

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采集常规饲养的健康许氏平鲉1日龄仔鱼,9、20日龄稚鱼,54、95日龄幼鱼,运用Illumina MiSeq PE300平台,对其肠道微生物的16S rDNA V3～V4可变区进行高通量测序,共获得1039个运算分类单位、667个属。在丰度高于1%的菌属水平上,野生鱼肠道菌群丰度的平均值(86%)远高于幼鱼时期的平均值(73.5%)。不动杆菌属为仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道中最优势菌属(丰度为26.2%～45.3%);短芽孢杆菌属次之。结合共有菌属分析获得11个核心菌群,芽孢杆菌属、短芽孢杆菌属、不动杆菌属、根瘤菌属等的丰度随仔鱼、稚鱼、幼鱼生长先升后降,均在54日龄时丰度最高;弧菌属则呈现相反的趋势(0.37%～12.41%),54日龄时丰度最低。仔鱼、稚鱼、幼鱼与野生个体肠道仅有14个共有菌属,短芽孢杆菌属、Massilia的最小丰度值分别是野生个体肠道中最大丰度值的9倍和32倍,差异明显。本研究揭示了许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道菌群结构特征及其发生、发育的过程,为苗种繁育阶段肠道生理健康调控提供理论依据。

分类号： S917.4

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