普通烟草DREB转录因子的序列鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡军华

作者： 胡军华;王大伟;杨明磊;王新;吴新儒;吴华;刘贯山

作者机构：

关键词： DREB转录因子;普通烟草;生物信息学;表达分析

期刊名称： 中国烟草科学

ISSN： 1007-5119

年卷期： 2017 年 38 卷 01 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： DREB转录因子含有一个保守的AP2/ERF结构域,在植物抗逆过程中起关键作用。利用生物信息学分析手段,以拟南芥DREB家族成员序列为参照,在普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组公共数据库中鉴定出了68个DREB转录因子。对烟草DREB转录因子家族进行了理化性质、系统进化、保守结构域和表达分析。结果表明,普通烟草基因组编码68个DREB转录因子家族成员,氨基酸数目差异较大;系统发育分析表明,拟南芥和烟草的DREB转录因子共125个成员形成6个进化分支,其中烟草比拟南芥缺少A6分支;结构域分析表明,同一分支内的DREB转录因子的保守结构域以及motif具有高度的一致性;组织表达分析表明,大多数DREB家族基因在烟草中表达量较低,在衰老、干旱和病害胁迫下基因表达量较多。此研究将为烟草DREB转录因子的深入分析奠定了生物信息学基础。

分类号： S572

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