辣椒EST-SSRs的分布特征及在品种多样性研究中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏兵强

作者： 魏兵强;刘飞云;马宗桓;陈灵芝;张茹

作者机构：

关键词： 辣椒;EST-SSR;分子标记;遗传多样性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 02 期

页码： 265-274

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为开发高效实用的EST-SSRs标记,从120605条辣椒无冗余EST序列中共搜索到10179条至少含有1个SSR的EST序列,占EST总数的8.44%。高频重复类型为一核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,占EST-SSRs总数的91.63%。最常见的基元是A/T,其次是TC/GA和CT/AG。设计合成了20对EST-SSRs引物并对25份辣椒材料进行了PCR扩增,结果表明:17对引物在供试辣椒材料中能扩增出明显的条带,其中12对引物扩增出42条多态性条带,平均多态性条带为3.5条,引物的多态性信息含量介于0.21～0.95之间。利用EST-SSRs标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致,表明本研究中开发的EST-SSRs标记可用于辣椒种质资源的遗传多样性分析。

分类号： S641.3

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