利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴红芬
作者: 吴红芬;张颖;侯冠彧;王颖;汪刘浩;吴科榜;那威
作者机构:
关键词: 文昌鸡;腹脂沉积;RNA-seq;差异表达基因;候选基因
期刊名称: 中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2023 年 59 卷 001 期
页码: 182-187
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因,旨在为低脂文昌鸡的分子育种提供理论依据.本研究结果显示,共有15996个基因在文昌鸡腹部脂肪组织中表达,16926个基因在儋州鸡腹部脂肪组织中表达,15580个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中均有表达,95个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中差异表达.GO富集分析结果显示差异表达基因显著富集在细胞过程、分子活性物质运输等过程(P<0.05).KEGG富集分析结果显示,差异表达基因在PPAR信号通路、TGF-β信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成等途径富集.通过筛选与验证,最后确定SCD、SMOC1、IGFBP2、MSMB基因为影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因.
分类号: S831.2
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