利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴红芬
作者: 吴红芬;张颖;侯冠彧;王颖;汪刘浩;吴科榜;那威
作者机构: 海南大学动物科技学院;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
关键词: 文昌鸡;腹脂沉积;RNA-seq;差异表达基因;候选基因
期刊名称: 中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2023 年 59 卷 001 期
页码: 182-187
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究利用RNA-seq技术筛选影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因,旨在为低脂文昌鸡的分子育种提供理论依据.本研究结果显示,共有15996个基因在文昌鸡腹部脂肪组织中表达,16926个基因在儋州鸡腹部脂肪组织中表达,15580个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中均有表达,95个基因在文昌鸡和儋州鸡腹部脂肪组织中差异表达.GO富集分析结果显示差异表达基因显著富集在细胞过程、分子活性物质运输等过程(P<0.05).KEGG富集分析结果显示,差异表达基因在PPAR信号通路、TGF-β信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成等途径富集.通过筛选与验证,最后确定SCD、SMOC1、IGFBP2、MSMB基因为影响文昌鸡腹脂沉积的重要候选基因.
分类号: S831.2
- 相关文献
[1]基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析. 岳晓凤,阙亚伟,王政逸. 2016
[2]高低产蛋鸡产蛋后期卵巢组织差异表达基因筛选及其功能分析. 陈林,王家乡,吴艳,皮劲松,蒲跃进. 2024
[3]基于RNA-Seq技术对不同品种猪排卵前卵泡差异表达基因的筛选与注释. 刘林清,李庆岗,苏世广,周梅,张威,王重龙. 2024
[4]基于RNA-Seq的甘蔗主茎和分蘖茎转录组建立及初步分析. 罗含敏,陈荣发,黄杏,陈忠良,范业赓,陈栋,李杨瑞,吴建明. 2018
[5]ZBED6基因敲除猪肾脏转录组分析. 田文杰,王丹丹,王圣楠,马月辉,蒋琳,宋子仪. 2022
[6]用ZBED6基因敲除猪研究心脏发育的分子机制. 王丹丹,唐雨婷,马月辉,王立刚,潘登科,蒋琳. 2018
[7]热应激下公兔睾丸组织形态和精液转录组分析. 蔡佳炜,张琛,靳荣帅,鲍志远,张希宇,王璠,翟频,赵博昊,陈阳,汤先伟,吴信生. 2023
[8]基于RNA-seq技术对不同品种猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释. 李小金,钱坤,刘林清,王重龙,周杰. 2016
[9]苹果叶片不定芽再生过程的差异表达基因鉴定与分析. 刘锴,何闪闪,张彩霞,张利义,卞书迅,袁高鹏,李武兴,康立群,丛佩华,韩晓蕾. 2021
[10]雏鸡红细胞免疫相关基因差异表达的时序性研究. 贾悦,李月健,喻进,张晨亮,李娜娜,卢晓晓,张宁,李欣,张鼎,郝卫芳,马海利,高文伟,赵宇军,高诗敏,李建慧,李桂兰,闫芳,韩凌霞,宁官保,田文霞. 2015
[11]黄羽肉鸡体尺性状与腹脂沉积相关性的研究. 郎倩倩,张燕,徐振强,张德祥. 2020
[12]饲粮添加牛至油对天露黄鸡腹脂沉积的影响. 魏付梁,卢逸华,潘木水,程武磊,高萍,王建兵,江青艳,朱晓彤. 2020
[13]不同饱和度油脂对AA肉鸡生长性能和腹脂沉积的影响. 李娟娟,佟建明,董晓芳,张琪,吴莹莹. 2008
[14]文昌鸡肉质相关基因多态性分析. 顾华兵,李慧芳,朱文奇,宋卫涛,韩威,徐文娟,陈宽维. 2011
[15]文昌鸡线粒体控制区遗传多态性及系统进化分析. 章明,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,高玉时. 2016
[16]微卫星标记多态性与文昌鸡蛋品质性状的相关分析. 赵东伟,钱凯,吴旭,李慧芳,陈宽维,汤青萍. 2009
[17]文昌鸡促卵泡素受体基因多态性分析. 李亨,陈宽维,李慧芳,肖晓珺,吴蓉蓉,朱文奇. 2010
[18]文昌鸡免疫性状与部分生长性能的相关分析. 王存波,常国斌,窦套存,曲亮,雷黎立,周琼,廖菁,包文斌,陈国宏. 2009
[19]文昌鸡性成熟启动过程中下丘脑EED、YY1基因表达规律分析. 盛中伟,韩威,李国辉,邹剑敏. 2016
[20]文昌鸡适宜能量水平研究. 刘宝铃,陈文峰,魏桂兰,朱文奇. 2011
作者其他论文 更多>>
-
健康与上草黄鳝菌群组成差异分析
作者:王颖;黄广华;周秋白;张锦华;周磊涛;包屹红;周文宗
关键词:黄鳝;养殖水体;体表粘液;肠道粘膜;菌群分析
-
乌梅丸调控Keap-1-Nrf2/HO-1信号通路抑制溃疡性结肠炎小鼠氧化应激损伤
作者:杜丽东;王颖;辛蕊华;仇正英;赵冠宇;李能莲;邵晶;吴国泰
关键词:乌梅丸;溃疡性结肠炎;Kelch-样ECH相关蛋白1-核因子E2相关因子2/血红素加氧酶1信号通路;氧化应激损伤
-
禽白血病病毒J亚群感染鸡组织中细胞受体chNHE1的表达分析
作者:张莉;于蒙蒙;王颖;王素艳;许壮壮;刘鹏;陈运通;祁小乐;李留安;高玉龙
关键词:J亚群禽白血病病毒;鸡钠氢交换蛋白1;组织表达;转录量变化
-
苜蓿草田间作功能植物对苜蓿蓟马及天敌小花蝽种群的影响
作者:魏淑花;刘学琴;王颖;刘畅;张蓉
关键词:苜蓿草田;功能植物;间作;蓟马;小花蝽;生态调控
-
河南省森林生态系统牛膝菊入侵风险评价
作者:胡京枝;尚兵;王颖;刘国伟;杨海青
关键词:河南省;森林生态系统;牛膝菊;风险评价
-
不同包装方式对龙滩珍珠李低温贮藏品质的影响
作者:黄展文;韦林艳;李明娟;游向荣;张雅媛;王颖;周葵
关键词:龙滩珍珠李;包装方式;低温贮藏;果实品质
-
5种干燥方式对木薯酸淀粉性能的影响
作者:李明娟;王颖;张雅媛;游向荣;周葵;卫萍;韦林艳
关键词:木薯酸淀粉;热风干燥;热泵干燥;真空冷冻干燥;喷雾干燥;晒干;淀粉性能