基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 鹿志伟

作者： 鹿志伟;侯晓婉;杨子平;张燕梅;李俊峰;周文钊

作者机构：

关键词： 剑麻;ARF;基因家族;转录组

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2019 年 010 期

页码： 1972-1978

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长素反应因子(Auxin Response Factors, ARFs)是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节.本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析.结果表明:在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF1~15.其编码的蛋白质含有409~1011个氨基酸,分子量约为45.17~112.13 ku,等电点为5.17~9.34.亚细胞定位预测结果显示,13个AhARFs定位于细胞核,2个AhARFs定位于叶绿体.保守结构域分析结果表明,AhARFs基因家族有8个成员同时含有B3、ARF和Aux/IAA这3个相对保守的结构域,其他成员仅含有B3和ARF这2个结构域.进化树分析表明,剑麻AhARFs蛋白可分为5个亚家族.15个剑麻AhARFs基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律.本研究为进一步深入探索剑麻ARF基因家族的功能奠定了重要理论基础.

分类号： S563.8

  • 相关文献

[1]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021

[2]剑麻与烟草疫霉互作过程中的转录组研究. 张燕梅,赵艳龙,李俊峰,鹿志伟,杨子平,陆军迎,周文钊. 2018

[3]烟草疫霉侵染前后剑麻叶片转录组学研究. 高建明,杨峰,郑金龙,刘巧莲,陈河龙,易克贤. 2014

[4]甘蓝型油菜转录因子SRS基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王龙,张永顺,王红艳,肖麓. 2024

[5]基于转录组的剑麻杂交种‘11648号’GATA基因家族的鉴定及表达分析. 鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊. 2020

[6]玉米生长素响应因子家族基因的表达模式分析. 李文兰,李文才,孙琦,于彦丽,赵勐,鲁守平,李艳娇,孟昭东. 2021

[7]生长素信号转导途径及参与的生物学功能研究进展. 张娟. 2009

[8]苹果果实大小相关的ARF-Aux/IAA互作组合筛选. 周喆,卞书迅,张恒涛,张瑞萍,高启明,刘珍珍,阎振立. 2021

[9]谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析. 赵艳,瓮巧云,马海莲,宋晋辉,袁进成,王凌云,董志平,刘颖慧. 2016

[10]梨全基因组生长素反应因子(ARF)基因家族鉴定及表达分析. 欧春青,姜淑苓,王斐,赵亚楠. 2018

[11]生长素响应因子(ARF)与植物遗传育种. 宋顺,黄东梅,马蔚红,王甲水,周兆禧,许奕. 2018

[12]不同处理方式的妃子笑荔枝花穗ARF基因家族的表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2018

[13]小G蛋白Arf的研究进展. 吴静,徐碧玉,金志强. 2007

[14]香蕉MaARF19-1基因的克隆及序列分析. 黄东梅,许奕,李敬阳,林妃,李艳霞,李羽佳,魏卿,宋顺. 2018

[15]无核荔枝生长素反应因子基因克隆及序列分析. 刘兴地,莫坤联,郑楷,郑学勤,李明芳. 2013

[16]浅析剑麻栽培技术. 习嘉民,谭施北,郑金龙,习金根. 2019

[17]剑麻H.11648叶片高产优选单株的鉴定与评价. 黄显雅,金刚,何如,覃旭,吴密,覃剑峰,彭欣怡,陈涛. 2020

[18]3种生防真菌对剑麻茎腐病病菌黑曲霉的抑制效果. 黄雪兰,李菊馨,周海兰,谢红辉. 2019

[19]剑麻EST-SSR在丝兰麻和中美麻中的通用性分析. 张燕梅,李俊峰,鹿志伟,杨子平,周文钊. 2021

[20]剑麻多倍体诱导及鉴定. 张世清,陈河龙,刘巧莲,高建明. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序