油莎豆SRAP-PCR体系优化及遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵琦琦
作者: 赵琦琦;郭玉静;于梦斐;王颖;高文伟;张斌
作者机构: 新疆农业大学农学院;山东省农业科学院农作物种质资源研究所;曲阜师范大学生命科学学院
关键词: 油莎豆;SRAP-PCR;扩增体系优化;遗传多样性
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2022 年 54 卷 008 期
页码: 31-38
收录情况: 北大核心
摘要: 以16份油莎豆种质资源为材料,用改良的CTAB法提取基因组DNA,利用单因素试验和正交试验研究引物浓度、混合酶体积和DNA模板含量3个因素对油莎豆SRAP-PCR扩增结果的影响,以优化其SRAP-PCR体系,并对供试油莎豆种质材料的遗传多样性进行分析.结果表明,混合酶体积对SRAP-PCR反应体系影响最大,引物浓度影响最小;油莎豆SRAP-PCR总体系为15μL时,引物浓度为0.5μmol/L、混合酶体积为10.5μmol/L、DNA模板含量为80 ng的扩增效果最佳.利用最佳扩增体系,从102对引物组合中筛选出30对多态性引物,共扩增出289个多态性位点,平均多态性比率为92.82%.进一步对16份油莎豆种质的遗传多样性进行分析,结果显示其遗传一致度范围为0.60~0.93,遗传距离范围为0.07~0.40,表明供试油莎豆种质资源的遗传背景差异较小;UPGMA聚类结果表明,油莎豆种质资源亲缘关系受油莎豆品种特性和地域的影响.本研究结果可为油莎豆种质资源的多样性评价及鉴定提供方法和技术,并为其遗传育种提供依据.
分类号: S565.903
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