巨桉CLE基因家族鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李靖思

作者: 李靖思;陆钊华;杨德明;秦健;李光友

作者机构:

关键词: 巨桉;短肽信号;CLE;基因家族;表达模式

期刊名称: 林业科学研究

ISSN: 1001-1498

年卷期: 2025 年 38 卷 004 期

页码: 42-52

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]鉴定巨桉CLE短肽家族成员,解析EgCLE基因在不同组织部位、激素处理和胁迫响应的表达模式,进而深入了解其在巨桉生长发育中的作用。[方法]通过生物信息学方法对巨桉CLE基因家族成员进行全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、进化与基因结构、蛋白保守结构域、启动子元件和表达模式进行分析。[结果]从巨桉基因组中共鉴定出13个EgCLE基因,不均匀分布在6条染色体上。从13个EgCLE基因中分离出12种十二氨基酸CLE肽,其中9个A型CLE肽,2个B型CLE肽,1个未知类型CLE肽。EgCLE基因编码83~140个氨基酸,绝大部分为酸性疏水性蛋白且均不稳定。大部分EgCLE基因为单外显子结构,且motif1在EgCLE家族中非常保守。顺式作用元件分析发现EgCLE家族成员启动子区域中包含多个生长发育、激素应答与胁迫响应元件。表达分析显示大多数EgCLE基因存在组织特异性表达模式。EgCLE基因对SA处理不敏感,而JA处理对EgCLE基因的表达量影响较大。部分EgCLE基因如EgCLE16、EgCLE27响应盐胁迫与营养胁迫。[结论]巨桉CLE基因家族成员在巨桉器官发育中起着重要的调控作用,EgCLE作为重要的短肽信号分子作用于巨桉的初生与次生生长、非生物胁迫响应等生物学过程,研究结果为后续解析EgCLE基因调控巨桉生长发育的分子机制提供理论基础。

分类号: S792.39

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