巨桉CLE基因家族鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李靖思
作者: 李靖思;陆钊华;杨德明;秦健;李光友
作者机构:
关键词: 巨桉;短肽信号;CLE;基因家族;表达模式
期刊名称: 林业科学研究
ISSN: 1001-1498
年卷期: 2025 年 38 卷 004 期
页码: 42-52
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]鉴定巨桉CLE短肽家族成员,解析EgCLE基因在不同组织部位、激素处理和胁迫响应的表达模式,进而深入了解其在巨桉生长发育中的作用。[方法]通过生物信息学方法对巨桉CLE基因家族成员进行全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、进化与基因结构、蛋白保守结构域、启动子元件和表达模式进行分析。[结果]从巨桉基因组中共鉴定出13个EgCLE基因,不均匀分布在6条染色体上。从13个EgCLE基因中分离出12种十二氨基酸CLE肽,其中9个A型CLE肽,2个B型CLE肽,1个未知类型CLE肽。EgCLE基因编码83~140个氨基酸,绝大部分为酸性疏水性蛋白且均不稳定。大部分EgCLE基因为单外显子结构,且motif1在EgCLE家族中非常保守。顺式作用元件分析发现EgCLE家族成员启动子区域中包含多个生长发育、激素应答与胁迫响应元件。表达分析显示大多数EgCLE基因存在组织特异性表达模式。EgCLE基因对SA处理不敏感,而JA处理对EgCLE基因的表达量影响较大。部分EgCLE基因如EgCLE16、EgCLE27响应盐胁迫与营养胁迫。[结论]巨桉CLE基因家族成员在巨桉器官发育中起着重要的调控作用,EgCLE作为重要的短肽信号分子作用于巨桉的初生与次生生长、非生物胁迫响应等生物学过程,研究结果为后续解析EgCLE基因调控巨桉生长发育的分子机制提供理论基础。
分类号: S792.39
- 相关文献
[1]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[2]陆地棉LTPG基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 吴翠翠,肖水平,夏芝,任文斌,任翔,张先亮. 2023
[3]11个玉米bZIP基因应答逆境胁迫的表达分析. 贾利强,赵秋芳,陈曙. 2022
[4]全基因组水平金银花TCP基因家族的鉴定及表达模式分析. 谭政委,郭水柱,苏小雨,孙瑶,余永亮,李磊,张利超,许兰杰,鲁丹丹,安素妨,李春明,梁慧珍,王子君. 2024
[5]普通烟草ERF转录因子亚家族成员鉴定及表达模式分析. 任昂彦,孔英珍. 2017
[6]大白菜GIF蛋白家族的生物信息学分析. 王凤德,李利斌,李化银,刘立峰,高建伟. 2012
[7]橡胶树HbWD40基因家族的全基因组分析. 赵一杰,杜晓愚,张世鑫,袁红梅,晁金泉. 2023
[8]棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张雪,孙瑞斌,马聪聪,马丹,张晓睿,刘志红,刘传亮. 2022
[9]亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王园园,赵春月,孙润润,秦腾飞,张金宝,郑巨云,杨秋月,翟勇全,孙家良,王清连. 2021
[10]大豆FAR1/FHY3基因家族鉴定与表达分析. 唐晓飞,薛永国,曹旦,孙建强,刘琦,朱梓菲,栾晓燕,王秀君,刘鑫磊. 2025
[11]瓠瓜CAT家族成员鉴定及响应白粉病菌的表达分析. 沈海斌,汪宽鸿,田守波,唐玉英,吴珏,陈春宏,张兆辉. 2024
[12]银杏C2H2型锌指蛋白家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 李建阳,熊思微,李贺勤,崔鹏,贺炳. 2024
[13]缢蛏
[14]甜瓜GATA基因家族的鉴定及表达分析. 侯银鹤,张永平,姚东伟,刁倩楠,田守波,乔宏宇,曹燕燕. 2025
[15]农杆菌介导巨桉Eg5高效遗传转化. 郭利军,曾炳山,刘英. 2013
[16]巨桉miRNA及其靶基因生物信息学预测. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014
[17]巨桉下胚轴诱导不定芽与植株再生的研究. 石轶松,王米力,杜文平,李群. 2002
[18]巨桉EgrWRKY70基因克隆和初步表达分析. 姚海荣,曾炳山,范春节,裘珍飞,郭光生,覃伟权,阎伟. 2016
[19]基于EST和GSS序列的巨桉miRNA研究. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014
[20]不同接种和处理方式对巨桉幼苗青枯病发生的影响. 范春节,姚海荣,曾炳山,王胜坤,郭光生,覃伟权. 2016
作者其他论文 更多>>
-
鲜食余甘子新品种绿田油甘的选育
作者:赖多;肖维强;秦健;庄庆礼;彭康宏;邵雪花
关键词:余甘子;新品种;绿田油甘;鲜食
-
脱氢醋酸钠处理对澳洲坚果果实保鲜效果及内生菌群落组成的影响
作者:贺鹏;王晓宇;张涛;宋海云;陈茜;张秀芬;汤秀华;涂行浩;秦健;王文林
关键词:澳洲坚果;脱氢醋酸钠;腐烂率;内生菌;微生物多样性
-
广西高山地区夏秋萝卜高效栽培技术
作者:黎炎;谭海文;秦健;程亮;吴永官;李玉洪;庄映红;覃柳兰;梁涵;李晶莹;吴全清;潘玲华
关键词:萝卜;栽培技术;高山地区
-
橄榄新品种青茵橄榄的选育
作者:肖维强;李祝成;陈盖洵;倪晓榕;赖多;庄庆礼;邵雪花;秦健;张力;林洁瑶;刘传滨
关键词:橄榄;新品种;青茵橄榄
-
基于文献计量视角的近20年国内外油梨研究态势分析
作者:赵志刚;秦健;王安娜;代建菊;赖多;肖维强;庄庆礼;邵雪花;何锴;董涛
关键词:油梨;VOSviewer;CiteSpace;可视化分析;研究热点
-
基于流式细胞仪鉴定番石榴倍性方法的建立及应用
作者:邵雪花;李桂兰;肖维强;赖多;庄庆礼;秦健
关键词:番石榴;花瓣;倍性鉴定;流式细胞术
-
余甘子斑点病病原菌鉴定、生物学特性及防治药剂筛选
作者:赖多;王德林;周国昌;邵雪花;秦健;庄庆礼;蔡时可;肖维强
关键词:余甘子;果实斑点病;间座壳菌;生物学特性;毒力测定
