不同嫩度徐州牛肌肉转录组比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 沈阳阳

作者： 沈阳阳;安振江;高林娜;夏淑雯;陈坤琳;丁强;高运东;薛金果;仲跻峰;王慧利

作者机构：

关键词： 徐州牛;背最长肌;转录组测序;肌肉嫩度

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 002 期

页码： 522-533

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】探究徐州牛不同嫩度背最长肌间的基因表达差异，挖掘相关调控基因和信号通路，为进一步研究徐州牛肌肉生长调控的作用机制提供理论依据。【方法】本研究以江苏地方特色牛种——徐州牛为研究对象，屠宰后对背最长肌进行剪切力测定，依据剪切力值大小分为高嫩度组6头(剪切力<5.5 kg)和低嫩度组4头(剪切力>7 kg),并对两组肌肉组织进行转录组测序，对数据进行过滤、质控、比对、定量后使用R语言DEseq2包筛选差异表达基因并进行功能富集分析。对差异极显著基因胱抑素B(cystatin B,CSTB)进行物种相似性比对及蛋白理化性质等分析。【结果】(1)转录组结果显示，相对于低嫩度组，高嫩度组中有94个基因上调、37个基因下调，位于前二十的差异表达基因包括CSTB、VWF、DIRAS3、CDKN1A、CFB等。(2)GO和KEGG富集分析发现，差异表达基因主要涉及凝血、免疫效应、伤口愈合等生物学过程，以及参与脂质代谢的Wnt信号通路等。基因通路网络分析发现，生物过程和分子功能中共同存在CSTB、PRKG1、PLAUR等差异表达基因。(3)牛CSTB基因与羊的相似性最高，为97.96%,其次是猪；蛋白理化性质发现，CSTB含有98个氨基酸残基，不稳定系数为33.17(<40),为稳定蛋白；蛋白二级结构预测显示，CSTB主要是由延伸链和无规则卷曲构成；STRING在线数据库分析结果显示，CSTB可能与CTSH、WC1-10、CTSB等存在相互作用。【结论】本研究筛选出影响徐州牛肌肉不同嫩度的差异表达基因CSTB、VWF、DIRAS3、CDKN1A、CFB等。研究结果可为牛肉品质研究提供理论依据和数据支撑。

分类号： S823

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