艾氏蛇鳗线粒体基因组全序列结构分析和系统发育关系探讨

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宁子君

作者： 宁子君;刘玉萍;张书飞;高天翔;杨天燕

作者机构：

关键词： 艾氏蛇鳗;高通量测序;线粒体基因组;系统发育分析

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2022 年 009 期

页码： 1264-1276

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究采用高通量测序技术获得了艾氏蛇鳗（Ophichthusevermanni）线粒体基因组全序列,并对其结构和特征进行了分析。结果表明,艾氏蛇鳗线粒体基因组全长17759bp,包含了13个蛋白编码基因（PCGs）、22个转运RNA基因（tRNA）、2个核糖体RNA基因（rRNA）、2个控制区（D-loop）和1个轻链复制起始区（OL）。线粒体DNA全序列的碱基组成分别为A （31.27%）、G （16.19%）、C （26.22%）和T （26.32%）,其中A+T含量（57.59%）大于G+C含量（42.41%）,呈现出明显的A+T偏好性。与大多数硬骨鱼类不同,艾氏蛇鳗线粒体基因组中发生了基因重排现象,ND6基因和tRNA-Glu移到了tRNA-Thr和tRNA-Pro之间,且ND6基因上游还存在另一个高度同源的D-loop区。tRNA-Gln （Q）、tRNA-Ala （A）、tRNA-Asn （N）、tRNA-Cys （C）、tRNA-Tyr （Y）、tRNA-SerUCA（S1）、tRNA-Glu （E）、tRNA-Pro （P）和ND6 9个基因位于L链,其余基因均位于H链。除tRNA-Ser （AGC）外,其余21个tRNA均为典型的三叶草二级结构。分别采用邻接法和最大似然法,基于12个蛋白编码基因（ND6除外）构建了蛇鳗科鱼类系统发育关系树。结果显示艾氏蛇鳗与短尾蛇鳗（O.brevicaudatus）和食蟹豆齿蛇鳗（Pisodonophiscancrivorus）的亲缘关系较近,蛇鳗属是蛇鳗科鱼类中分化较晚的一个类群。研究结果丰富了蛇鳗科鱼类线粒体基因组数据库,也为该类群鱼类的系统分类研究提供了参考资料。

分类号： S917.4

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