三疣梭子蟹钙调蛋白基因的克隆及在蜕皮中的功能分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张龙涛
作者: 张龙涛;吕建建;高保全;刘萍
作者机构: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
关键词: 三疣梭子蟹;钙调蛋白;基因克隆;基因表达;去眼柄
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2015 年 22 卷 06 期
页码: 1150-1159
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 基于转录组数据库信息,采用RACE技术克隆获得三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)钙调蛋白基因(PTCaM)。该基因cDNA全长1981 bp,包含450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,预测分子量16.8 k D,理论等电点为4.09。对序列进行生物信息学分析发现,PTCaM是一个高度保守的序列,具有EF家族典型的EF-hand钙离子结合域。同源性分析结果表明,PTCaM基因编码的氨基酸与果蝇和中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的Ca M氨基酸序列覆盖率高达100%,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、克氏原螯虾(Procambarus clarkia)和仿刺参(Apostichopus japonicus)覆盖率高达99%。系统进化表明,PTCaM基因氨基酸序列与凡纳滨对虾、中华绒螯蟹和克氏原螯虾聚为一支。通过分析不同蜕皮时期各个组织中PTCaM的表达情况得知,该基因在蜕皮时期的各个组织中均出现差异性表达,并且差异显著,说明该基因参与蜕皮调控过程。
分类号: S917.4
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