陆地棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定与功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 潘奥

作者： 潘奥;王静静;孙福来;张景霞;高阳;杜召海;焦梦佳;张军;王芙蓉;刘志

作者机构：

关键词： 陆地棉;NF-YA基因家族;生物信息学;表达分析;病毒诱导基因沉默(Virus-induced gene silencing,VIGS)

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2020 年 32 卷 04 期

页码： 316-328

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过对陆地棉NF-YA基因家族进行全基因组鉴定,分析其表达特性,鉴定其中与棉花开花相关的基因。【方法】利用生物信息学方法系统分析了其理化性质、基因结构、共线性、Ka/Ks、顺式作用元件和表达模式,实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)分析表达特征,采用病毒诱导基因沉默技术验证基因功能。【结果】陆地棉中鉴定到29个NF-YA基因家族成员,分为5个亚组,定位在18条染色体上;全基因组复制和片段复制是GhNF-YA基因家族扩张的主要动力;启动子区含有大量光反应的顺式作用元件。GhNF-YA基因家族基因在茎、叶中高表达;12个GhNF-YA基因在早熟品种鲁棉研19号和晚熟品种鲁棉研37号中均在第三至六叶时期表达量较高,并且大部分基因在品种间表达差异显著。沉默GhNF-YA18基因的鲁棉研37号植株比对照提前11 d现蕾,并且该基因在白化期和现蕾期的表达量均低于未沉默对照棉株。【结论】本研究对陆地棉NF-YA基因家族进行了鉴定和表达分析,为进一步研究棉花开花调控的分子机制奠定了基础。

分类号： S562

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